Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  262  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86158094--86158206
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57
3
4
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1.34
86210938--86210982
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3
47
26
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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1.95
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240
2.0
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16
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1.8
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239
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16
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4.0
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16
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3.0
12
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0
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24
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1.46
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1.36
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4.5
27
68
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32
1.46
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1.67
86228117--86228231
60
1.9
60
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0
203
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26
2.1
26
83
16
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63
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2.2
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1.9
18
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0
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60
2
31
5
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
18
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2
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1.32
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18
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41
40
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18
1.51
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8
62
43
36
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19
1.51
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13
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25
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2.0
13
100
0
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38
38
7
15
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86286579--86286624
12
4.0
12
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11
51
32
4
28
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1.77
86286579--86286622
22
2.0
22
95
0
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34
4
29
31
1.78
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11
3.1
11
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14
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17
11
8
1.52
86302563--86302632
30
2.4
30
81
15
92
62
17
11
8
1.52
86305626--86305769
51
2.9
51
80
6
168
28
24
20
27
1.99
86308185--86308225
21
2.0
21
90
0
64
19
26
29
24
1.98
86308191--86308238
21
2.3
21
77
0
51
25
31
25
18
1.98
86312117--86312214
38
2.6
38
85
4
126
41
18
6
33
1.75
86316147--86316171
13
1.9
13
100
0
50
32
24
8
36
1.84
86326634--86326667
6
5.5
6
86
6
50
14
5
0
79
0.91
86331074--86331117
23
2.0
23
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13
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70
4
0
25
1.06
86332023--86332076
21
2.7
20
88
8
83
31
5
3
59
1.38
86333081--86333105
7
3.6
7
100
0
50
28
0
12
60
1.32
86334889--86335360
233
2.0
234
93
0
811
24
20
20
33
1.97
86335122--86335420
126
2.4
126
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0
571
24
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20
32
1.98
86335195--86335646
225
2.0
225
97
0
850
25
20
18
34
1.96
86335323--86335519
99
2.0
99
98
0
385
25
19
19
35
1.95
86335420--86335714
126
2.3
126
96
0
545
25
20
18
35
1.95
86335724--86335763
19
2.1
19
85
0
53
45
20
2
32
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86335836--86335908
19
3.8
19
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7
67
45
20
1
32
1.60
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14
3.9
14
75
20
60
48
37
0
14
1.45
86335976--86336030
21
2.6
21
94
5
94
49
36
0
14
1.44
86337435--86337504
19
3.8
18
77
22
67
70
1
1
27
1.05
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16
2.9
16
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21
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2
0
28
1.00
86340335--86340415
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2.6
31
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101
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7
2
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1.45
86340432--86340476
21
2.1
21
84
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4
0
28
1.11
86341951--86341993
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2.5
17
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20
4
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60
1.51
86347530--86347820
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4.6
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230
28
22
25
23
1.99
86347537--86347820
126
2.3
125
78
4
286
28
21
26
23
1.99
86350536--86350760
40
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3
290
25
28
23
23
2.00
86353473--86353515
20
2.2
20
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0
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18
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44
1.71
86353471--86353648
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79
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178
19
33
3
43
1.70
86355028--86355073
10
4.7
10
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15
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28
4
0
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1.10
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35
0
0
64
0.94
86355018--86355056
21
1.9
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35
0
0
64
0.94
86355113--86355166
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2.4
22
84
9
65
27
0
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1.13
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55
4.9
59
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340
44
6
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45
1.46
86355300--86355578
114
2.4
115
81
9
354
44
6
3
45
1.46
86355576--86355681
43
2.5
43
93
3
178
48
11
4
35
1.60
86364207--86364294
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3.1
29
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4
117
27
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28
30
1.94
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13
2.6
13
90
4
50
39
0
12
48
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86375597--86375669
6
12.0
6
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8
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17
4
1
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1.01
86375597--86375664
25
2.8
24
85
12
86
17
2
1
77
0.96
86375624--86375691
18
3.9
17
80
16
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22
4
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72
1.11
86377465--86377525
17
3.5
17
82
4
77
52
3
11
32
1.54
86380284--86380461
27
6.6
27
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205
29
28
15
26
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86380305--86380460
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1.9
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233
29
28
15
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1.96
86382648--86382762
3
37.3
3
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6
7.2
6
79
15
52
64
0
0
35
0.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352