Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  341  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109267396--109267439
12
3.6
12
90
3
61
63
0
6
29
1.20
109267425--109267500
5
14.2
5
73
21
57
59
1
3
35
1.24
109269096--109269185
45
2.0
45
97
0
171
42
2
23
32
1.66
109269111--109269185
22
3.4
22
65
17
64
48
2
20
29
1.63
109280734--109280794
30
2.0
30
100
0
122
29
40
9
19
1.84
109297184--109297402
41
5.4
40
90
3
215
32
22
23
21
1.98
109297218--109297403
41
4.6
41
92
0
302
30
22
24
22
1.99
109297444--109297491
22
2.1
22
84
3
60
50
25
0
25
1.50
109297384--109297622
119
2.0
119
100
0
478
45
28
4
22
1.71
109297563--109297626
23
2.8
23
81
11
62
48
26
0
25
1.51
109297823--109297858
15
2.5
15
90
4
56
22
0
33
44
1.53
109298035--109298079
14
3.2
14
83
0
54
28
0
24
46
1.53
109298075--109298125
22
2.4
22
83
9
70
27
1
21
49
1.60
109297682--109298202
282
1.9
281
86
4
764
31
2
21
43
1.66
109298508--109298542
17
2.1
17
89
10
54
77
5
0
17
0.96
109301615--109301682
35
1.9
35
93
0
118
39
10
19
30
1.85
109301678--109301819
43
3.3
43
83
0
185
29
27
16
26
1.97
109302141--109302174
17
1.9
18
94
5
61
23
29
11
35
1.90
109302896--109302928
5
6.8
5
86
6
50
18
3
0
78
0.87
109302896--109302928
14
2.3
15
89
5
50
18
3
0
78
0.87
109302897--109302927
9
3.3
9
91
8
53
19
3
0
77
0.90
109307275--109307307
5
6.8
5
86
6
50
18
3
0
78
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109307276--109307306
14
2.2
14
94
0
53
19
3
0
77
0.90
109307713--109307765
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
109310012--109310109
43
2.3
43
87
3
144
24
17
29
28
1.97
109310082--109310139
30
1.9
30
96
0
107
17
18
31
32
1.94
109310037--109310182
73
2.0
73
89
5
224
23
19
28
28
1.98
109317659--109317784
3
43.0
3
70
16
77
61
4
2
31
1.30
109317744--109317794
23
2.1
25
85
10
70
66
5
3
23
1.30
109319265--109319826
44
12.9
44
72
10
420
22
22
20
35
1.96
109319210--109319826
175
3.5
174
85
5
791
21
23
20
35
1.96
109319207--109319826
87
7.1
87
84
2
789
21
22
20
35
1.96
109319824--109319915
43
2.1
44
83
2
114
25
25
21
28
1.99
109332125--109332176
26
2.0
26
84
3
68
63
3
5
26
1.34
109332416--109332457
3
14.0
3
94
0
75
66
2
0
30
1.04
109332514--109332570
17
3.4
17
72
0
51
66
5
3
24
1.28
109332519--109332570
23
2.3
23
83
6
61
65
5
3
25
1.32
109335354--109335396
19
2.2
19
87
4
59
32
0
13
53
1.41
109335367--109335404
19
2.0
19
89
0
58
36
0
10
52
1.36
109336827--109337120
153
1.9
153
81
4
351
22
21
17
39
1.93
109341478--109341805
3
107.0
3
66
23
102
62
1
3
32
1.21
109341527--109341749
20
11.2
19
71
19
127
62
0
2
34
1.13
109341485--109341746
101
2.6
103
76
15
253
62
0
3
33
1.18
109341484--109341751
61
4.3
61
71
21
163
62
0
3
33
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109341483--109341806
28
10.9
30
66
24
95
62
1
3
32
1.19
109341772--109341812
20
2.0
20
86
9
57
63
2
0
34
1.08
109343944--109344025
26
3.2
26
98
0
155
30
6
26
36
1.81
109345507--109345559
26
2.0
26
82
7
63
39
20
15
24
1.91
109347188--109347356
52
3.3
52
86
6
215
27
13
29
28
1.94
109349609--109349706
19
5.2
19
86
7
137
38
9
16
35
1.80
109349609--109349706
36
2.6
37
85
9
126
38
9
16
35
1.80
109351453--109351505
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
109352983--109353047
32
2.0
32
100
0
130
38
24
6
30
1.80
109354049--109354107
29
2.0
29
96
0
109
25
6
32
35
1.82
109354606--109354636
16
1.9
16
93
0
53
29
25
32
12
1.93
109354660--109354750
44
2.0
44
89
2
137
36
19
30
13
1.90
109356955--109357002
25
1.9
25
87
8
71
33
0
12
54
1.38
109361510--109361560
26
1.9
27
84
4
68
19
13
13
52
1.73
109361714--109361743
12
2.5
12
94
0
51
16
20
0
63
1.31
109370824--109370867
22
2.0
21
83
12
54
59
4
2
34
1.30
109371053--109371105
27
2.0
25
82
7
61
60
1
1
35
1.19
109374868--109374892
13
1.9
13
100
0
50
32
20
8
40
1.81
109376148--109376182
16
2.1
17
94
5
63
25
11
0
62
1.28
109381401--109381964
4
141.0
4
99
0
1119
25
0
24
50
1.50
109383059--109383132
36
2.1
36
94
0
130
21
6
35
36
1.80
109383443--109383487
20
2.2
20
100
0
90
42
8
20
28
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109384025--109384065
16
2.6
16
79
20
50
46
0
0
53
1.00
109384165--109384226
19
3.2
19
69
13
63
38
9
14
37
1.79
109384159--109384236
39
2.0
39
97
0
147
37
10
16
35
1.83
109384313--109384381
29
2.3
29
80
9
77
44
11
17
26
1.82
109389708--109390226
153
3.4
153
91
2
796
24
21
16
37
1.94
109391593--109391801
105
2.0
105
93
1
357
34
9
10
46
1.69
109395142--109395171
15
1.9
16
93
6
53
16
40
0
43
1.48
109397432--109397508
38
2.0
38
87
0
109
41
1
11
45
1.49
109401395--109401427
17
1.9
17
100
0
66
36
0
0
63
0.95
109401674--109401729
16
3.5
16
87
0
67
28
25
7
39
1.82
109402931--109403008
15
5.2
15
70
11
70
43
7
23
25
1.80
109402924--109403008
30
2.8
30
96
0
152
44
7
23
24
1.78
109407585--109407662
15
5.2
15
70
11
70
43
7
23
25
1.80
109407578--109407662
30
2.8
30
96
0
152
44
7
23
24
1.78
109415788--109415829
20
2.1
20
95
0
75
30
23
7
38
1.82
109417931--109417956
3
8.7
3
100
0
52
34
0
0
65
0.93
109418215--109418274
23
2.7
23
78
2
59
35
10
6
48
1.63
109430770--109430912
44
3.2
44
66
15
123
27
25
20
25
1.99
109430756--109431090
87
3.9
88
87
4
421
30
22
22
24
1.99
109430802--109430938
45
3.2
42
65
14
116
29
21
24
25
1.99
109431134--109431177
21
2.1
21
87
8
63
36
25
34
4
1.76
109431260--109431418
44
3.6
43
81
5
160
29
23
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109436898--109436965
21
3.2
20
66
25
50
41
20
13
25
1.88
109436877--109436975
43
2.3
43
87
6
148
40
17
14
28
1.88
109436896--109436963
22
3.1
21
66
26
52
42
20
11
25
1.86
109439532--109439576
3
15.0
3
81
9
56
0
37
0
62
0.96
109447002--109447030
8
3.6
8
100
0
58
34
0
0
65
0.93
109448465--109448580
60
1.9
60
98
0
223
20
37
17
24
1.93
109449976--109450242
133
2.0
134
97
0
509
32
12
16
38
1.86
109450186--109450332
74
2.0
73
90
1
231
32
10
26
30
1.89
109451136--109451187
20
2.6
20
96
0
95
9
30
38
21
1.85
109451974--109452136
52
3.1
51
80
7
184
30
28
16
23
1.96
109453327--109453365
17
2.3
17
86
0
51
30
10
2
56
1.46
109454551--109454585
16
2.2
16
89
0
52
40
20
14
25
1.90
109454482--109454682
99
2.0
100
90
2
316
42
15
15
26
1.87
109456629--109456660
16
2.0
16
93
0
55
43
21
0
34
1.53
109457624--109457659
16
2.2
16
90
9
56
33
5
0
61
1.19
109464707--109465250
46
11.8
46
92
1
806
21
23
14
40
1.90
109467375--109467527
40
3.9
40
96
0
265
30
18
3
47
1.65
109467375--109467527
79
1.9
79
93
2
263
30
18
3
47
1.65
109470656--109470693
14
2.7
14
83
0
58
68
13
2
15
1.32
109470733--109470784
21
2.5
21
84
6
61
71
13
11
3
1.28
109471728--109471755
7
4.0
7
100
0
56
57
0
0
42
0.99
109473733--109473766
6
5.7
6
100
0
68
35
14
0
50
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109476422--109476529
4
27.5
4
81
3
85
42
0
56
0
1.05
109476422--109476531
26
4.4
26
73
11
77
43
0
55
0
1.06
109476423--109476529
28
3.8
30
77
12
109
42
0
56
0
1.05
109476818--109476892
18
4.4
18
66
17
61
44
1
2
52
1.23
109477678--109477762
27
3.1
27
89
0
143
22
29
37
10
1.88
109477861--109477925
4
15.5
4
73
20
53
67
0
29
3
1.05
109477855--109477920
21
3.1
20
82
10
78
66
0
30
3
1.06
109477856--109477925
25
2.8
25
95
2
122
67
0
30
2
1.05
109484316--109485466
145
8.0
142
84
8
1424
27
6
7
58
1.50
109484312--109485466
430
2.7
425
86
6
1613
27
6
7
58
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352