Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  310  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101260822--101260875
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1.93
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2.4
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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67
1.13
101410995--101411053
29
2.0
29
81
12
68
27
8
0
64
1.22
101411021--101411060
15
2.5
15
92
8
62
27
7
0
65
1.20
101410985--101411105
44
2.7
45
78
15
128
28
9
0
62
1.25
101417457--101417590
45
3.0
45
85
4
173
29
19
23
27
1.98
101417326--101417681
179
2.0
178
90
0
559
29
18
21
30
1.97
101417682--101418087
88
4.9
82
84
6
407
34
21
23
20
1.97
101417943--101418087
74
2.0
73
91
1
236
29
22
25
22
1.99
101418029--101418226
44
4.2
45
70
21
131
31
23
26
18
1.97
101418033--101418142
55
2.0
55
100
0
220
32
21
30
14
1.93
101418088--101418267
88
2.1
87
93
1
306
32
22
24
20
1.97
101418209--101418309
43
2.3
44
87
1
141
34
23
16
24
1.95
101418128--101418315
44
4.3
44
71
11
170
33
21
21
22
1.97
101419745--101419843
44
2.2
45
89
3
148
29
22
20
28
1.98
101420798--101420914
15
8.1
14
72
17
62
25
7
1
64
1.29
101420835--101420868
14
2.3
15
90
5
52
26
5
0
67
1.13
101420835--101420893
29
2.0
29
81
12
68
27
8
0
64
1.22
101420861--101420906
15
2.9
15
90
6
65
26
6
0
67
1.15
101420873--101420939
21
3.0
23
76
21
72
29
5
0
64
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101420829--101420950
52
2.4
54
74
18
125
27
7
0
64
1.20
101427868--101427943
39
1.9
39
100
0
152
31
5
15
47
1.68
101428013--101428060
23
2.0
25
84
8
64
27
0
6
66
1.15
101428268--101428340
22
3.1
22
64
21
58
47
2
13
35
1.57
101428242--101428340
48
2.1
48
100
0
198
46
4
14
35
1.63
101428242--101428321
26
3.2
26
66
20
80
45
5
13
36
1.66
101431341--101431386
20
2.3
20
100
0
92
39
15
8
36
1.78
101432689--101432732
6
7.2
6
92
2
61
34
43
0
22
1.54
101441223--101441261
5
7.6
5
82
5
51
41
17
0
41
1.50
101449576--101449791
46
4.6
46
75
17
180
27
18
30
24
1.98
101449574--101449901
47
6.9
49
74
16
189
26
18
29
25
1.98
101452305--101452350
23
2.0
23
82
0
56
39
17
23
19
1.92
101452888--101452926
5
7.6
5
82
5
51
41
17
0
41
1.50
101480057--101480134
31
2.6
30
82
13
90
39
11
11
37
1.78
101480057--101480138
29
2.8
27
77
18
76
40
10
10
37
1.76
101485533--101485566
15
2.3
15
89
0
50
55
0
2
41
1.15
101486734--101486765
16
2.0
16
100
0
64
37
18
12
31
1.88
101495327--101495364
12
2.9
13
84
11
51
0
26
0
73
0.83
101495324--101495395
25
2.8
25
78
14
76
1
20
4
73
1.07
101495803--101495844
21
2.0
21
100
0
84
28
14
33
23
1.94
101497410--101497455
22
2.1
22
84
8
58
39
4
0
56
1.19
101500375--101500425
19
2.7
19
87
6
68
56
0
0
43
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101502183--101502223
20
2.1
19
86
13
57
68
2
4
24
1.22
101514456--101514515
26
2.2
26
82
11
68
60
3
3
33
1.30
101514683--101514716
17
2.1
16
94
5
59
73
0
0
26
0.83
101514691--101514737
18
2.5
20
76
16
55
70
2
0
27
0.99
101516462--101516838
176
2.1
176
89
2
580
25
20
19
34
1.96
101528606--101528653
20
2.5
20
87
9
66
68
2
0
29
1.01
101528605--101528667
18
3.5
17
83
10
72
63
1
0
34
1.04
101533125--101533249
54
2.3
54
81
2
144
28
25
26
19
1.98
101533260--101533324
21
3.1
21
75
2
60
29
26
30
13
1.94
101533221--101533451
126
1.8
126
86
3
340
29
21
26
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352