Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  65  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20407610--20407651
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2.0
21
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0
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0
1.00
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26
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30
1.93
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0
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20448841--20448887
21
2.3
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31
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29
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29
29
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29
29
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40
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160
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1.9
237
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0
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29
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32
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5.1
140
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2.8
209
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22
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10
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0
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0
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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2.0
31
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0
86
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142
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2.0
26
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22
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2.3
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2
2
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2.0
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0
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1
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16
0
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126
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26
1.96
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5.2
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8
3
41
1.50
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67
21
201
47
8
3
40
1.52
20515225--20515607
116
3.3
115
93
0
640
47
8
3
40
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20515292--20515593
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40
1.52
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2.4
18
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0
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1.77
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2.2
30
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6
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1.72
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15
2.1
15
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0
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70
0
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22
1.09
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0
28
28
1.56
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1.54
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42
0
28
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1.56
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2.0
40
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24
1.92
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2.0
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30
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1.12
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2.1
17
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2
7
23
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20563739--20563785
19
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2
2
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1.23
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2.2
25
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65
52
3
3
39
1.37
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3
36
1.34
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1.74
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28
1.95
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132
6.5
129
86
4
816
23
32
16
27
1.96
20570798--20570920
61
2.0
64
88
7
191
38
12
16
33
1.85
20581407--20581450
17
2.6
17
77
0
52
54
2
9
34
1.44
20582226--20582304
39
2.0
39
95
0
140
24
27
5
43
1.75
20585166--20585233
12
5.7
11
76
13
55
33
5
2
57
1.38
20585373--20585557
25
7.8
24
70
17
118
34
3
4
57
1.34
20585420--20585509
11
8.5
11
74
18
50
35
2
2
60
1.22
20585442--20585475
10
3.3
10
84
8
50
32
0
0
67
0.91
20585435--20585517
14
6.4
14
70
23
58
33
2
1
62
1.16
20585424--20585518
48
2.0
48
84
12
124
33
2
2
62
1.19
20585805--20585856
26
2.0
26
84
0
68
28
9
3
57
1.48
20597361--20597428
16
4.2
16
96
0
127
26
0
35
38
1.57
20597664--20597698
18
2.0
17
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52
54
0
0
45
0.99
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18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
20597647--20597894
120
2.1
120
100
0
496
48
5
2
43
1.38
20601169--20601547
88
4.3
87
66
16
238
29
17
23
29
1.97
20601264--20601682
90
4.6
89
71
12
302
31
16
21
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20601337--20601415
41
1.9
41
84
0
104
31
16
21
30
1.95
20601245--20601733
135
3.6
135
72
11
437
31
17
21
29
1.96
20601112--20601584
133
3.5
133
73
10
478
28
17
23
29
1.97
20601110--20601738
268
2.3
268
93
0
1053
30
17
22
29
1.97
20601693--20601867
89
2.0
89
93
2
298
34
22
18
24
1.96
20601693--20601888
89
2.2
89
89
1
295
33
23
17
25
1.97
20603565--20603632
12
5.7
11
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13
55
33
5
2
57
1.38
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19
2.8
20
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5
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37
0
3
58
1.15
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2.4
13
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0
53
41
0
0
58
0.98
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15
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14
71
25
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38
2
1
56
1.25
20603795--20603902
14
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14
66
21
56
37
2
1
58
1.23
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25
3.6
25
69
23
78
33
5
3
56
1.40
20603817--20603897
40
2.0
40
83
6
103
34
2
2
60
1.23
20603839--20603942
45
2.2
45
80
12
113
33
4
2
58
1.34
20604189--20604240
26
2.0
26
84
0
68
28
9
3
57
1.48
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17
2.2
16
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5
54
41
2
2
52
1.30
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19
2.3
19
88
8
61
37
9
6
46
1.63
20610355--20610393
17
2.4
17
82
4
53
76
5
2
15
1.06
20613511--20613580
37
1.9
36
85
8
97
41
1
2
54
1.24
20613657--20613706
23
2.1
24
85
3
66
44
2
2
52
1.24
20616177--20616386
33
6.4
33
78
2
199
29
22
11
36
1.90
20616206--20616386
65
2.8
64
77
7
202
31
20
11
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20616379--20616506
29
4.4
29
92
0
211
25
28
11
35
1.91
20617952--20618021
21
3.3
21
85
0
86
41
18
12
27
1.87
20628015--20628113
17
5.6
17
88
7
144
38
12
13
36
1.81
20628007--20628113
35
3.0
35
95
4
187
38
11
14
36
1.81
20628015--20628113
18
5.6
18
90
4
157
38
12
13
36
1.81
20628630--20628679
26
1.9
26
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0
64
36
4
0
60
1.16
20631677--20631734
26
2.3
25
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3
71
70
0
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5
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29
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0
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82
28
5
2
62
1.33
20645707--20645777
32
2.3
30
77
15
74
40
7
0
52
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352