Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  266  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87307552--87307597
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21
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1
2
35
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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2.2
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2
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12
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62
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13.3
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76
5
56
16
7
4
71
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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23
20
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1
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21
24
20
34
1.97
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128
1.8
128
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348
20
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21
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19
24
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0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87502397--87502454
23
2.4
25
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27
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1.37
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127
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20
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91
4
80
46
14
12
26
1.79
87523974--87524240
82
3.4
80
85
3
296
47
22
8
21
1.78
87523985--87524240
77
3.3
77
84
5
318
46
23
8
21
1.79
87531367--87531477
54
2.1
53
85
8
145
45
8
10
35
1.69
87531441--87531513
36
2.0
36
84
5
94
49
8
8
34
1.62
87531459--87531614
45
3.2
48
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17
133
42
10
11
35
1.75
87531642--87531714
36
2.0
36
91
0
119
47
9
9
32
1.68
87531722--87531812
45
2.0
45
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4
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38
10
14
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1.81
87534043--87534138
24
4.2
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19
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25
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18
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1.94
87534056--87534146
24
3.8
23
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9
114
24
20
18
36
1.95
87534076--87534155
24
3.3
23
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11
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23
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21
33
1.97
87535939--87535969
12
2.6
12
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0
22
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78
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9
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9
80
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0
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1
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26
2.0
26
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0
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1
0
50
1.12
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17
2.0
17
88
0
50
35
11
14
38
1.83
87550837--87550882
19
2.4
19
81
0
56
65
0
2
32
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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114
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27
1.81
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39
2.8
39
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0
198
26
27
21
24
1.99
87564521--87564686
78
2.1
77
80
5
174
25
27
21
25
2.00
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19
2.2
19
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0
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26
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0
0
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0
0
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83
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1.76
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2.0
161
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29
1.80
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1.9
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22
1.98
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1.34
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3
20.7
3
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21
2.9
21
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0
77
32
3
3
60
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21
2.0
21
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0
64
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29
21
29
1.98
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12
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0
0
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14
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5
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28
0
2
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2.4
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0
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32
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2.1
38
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10
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2.3
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8
297
41
11
28
18
1.85
87618967--87619190
118
1.9
118
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312
41
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18
1.86
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48
2.0
48
98
0
187
27
18
22
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
87621981--87622019
18
2.2
19
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0
2
15
0.79
87621983--87622022
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3.2
13
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13
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80
0
5
15
0.88
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2.6
17
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29
92
0
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2
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87634600--87634789
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258
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138
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13
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45
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51
2.0
51
94
0
177
33
4
29
32
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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