Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  46  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14566591--14566630
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0
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2.0
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0
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3.8
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22
25
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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22
25
1.79
14664972--14665086
30
3.8
30
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0
194
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25
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124
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2.0
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50
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2.0
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21
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2.1
16
88
0
50
50
14
17
17
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1
44
1.42
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4.4
9
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0
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22
74
9
65
44
2
0
52
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14797622--14797662
21
2.0
21
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0
64
19
29
21
29
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1.75
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0
0
51
1.00
14831446--14831486
11
3.7
11
83
0
55
58
9
12
19
1.61
14831437--14831496
22
2.7
22
82
5
68
58
11
10
20
1.61
14836717--14836899
92
2.0
92
96
0
339
26
13
22
37
1.92
14848653--14848702
24
2.0
26
84
7
68
38
2
0
60
1.09
14848653--14848692
15
2.5
16
84
8
55
35
2
0
62
1.09
14848632--14848726
30
3.3
30
73
18
94
42
1
0
56
1.06
14853376--14853434
30
2.0
30
90
3
93
49
3
25
22
1.65
14859504--14859537
16
2.2
15
89
5
50
79
8
2
8
1.03
14865487--14865523
3
12.3
3
100
0
74
67
32
0
0
0.91
14876486--14876519
13
2.7
12
90
9
50
2
11
0
85
0.71
14877351--14877379
14
2.0
15
93
6
51
41
0
6
51
1.28
14879363--14879463
49
2.1
48
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10
120
6
49
2
40
1.45
14880042--14880212
84
2.0
84
93
0
288
19
33
21
25
1.97
14881656--14881708
11
4.9
10
76
17
52
3
18
3
73
1.14
14881656--14881697
21
2.0
21
85
4
57
2
21
4
71
1.16
14882589--14882658
30
2.3
30
80
4
88
34
10
24
31
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14883423--14883448
11
2.4
11
100
0
52
7
7
15
69
1.35
14885040--14885105
30
2.2
30
89
10
100
28
4
9
57
1.49
14885225--14885258
12
2.8
12
90
0
50
67
0
0
32
0.91
14888509--14888545
13
2.8
14
84
12
51
72
0
0
27
0.84
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52
2.0
52
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0
201
45
10
7
36
1.67
14893092--14893136
11
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11
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11
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0
2
62
1.08
14893087--14893142
24
2.3
24
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3
67
37
0
3
58
1.15
14895277--14895442
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3.9
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12
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24
21
1.93
14895319--14895486
46
3.7
46
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1
203
41
15
23
19
1.90
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20
2.6
21
85
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64
3
1
29
1.21
14896672--14896728
21
2.7
22
81
13
66
64
3
1
29
1.20
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21
2.0
21
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0
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19
29
21
29
1.98
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9
80
30
18
10
40
1.84
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20
2.1
20
100
0
84
35
0
4
59
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2.0
22
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2
0
40
1.11
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18
2.2
19
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57
57
0
5
37
1.21
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2.0
15
100
0
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46
6
6
40
1.56
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2.0
15
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6
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58
0
0
41
0.98
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9
2.8
9
100
0
50
28
0
0
72
0.86
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12
2.9
13
88
12
58
44
0
0
55
0.99
14927513--14927558
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
14927520--14927564
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14932748--14932807
30
2.0
30
83
3
77
45
3
21
30
1.68
14933018--14933048
13
2.4
13
94
0
53
32
0
12
54
1.38
14933143--14933335
50
3.8
50
89
0
287
26
23
29
20
1.99
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24
2.0
24
87
0
69
52
16
2
29
1.56
14942000--14942149
42
3.5
42
80
5
178
29
24
14
32
1.95
14945893--14945930
20
1.9
19
94
5
67
44
2
0
52
1.14
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24
3.1
24
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4
121
47
0
2
50
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0
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1.9
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46
17
21
14
1.83
14948375--14948504
25
5.2
26
75
10
85
41
20
23
15
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352