Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  297  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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2.1
170
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22
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21
18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97523526--97523573
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138
32
27
5
34
1.79
97524138--97524205
16
4.2
16
96
0
118
35
36
0
27
1.58
97525197--97525234
16
2.4
16
95
0
67
39
7
0
52
1.31
97533001--97533029
13
2.3
13
94
5
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82
0
0
17
0.66
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18
2.0
18
88
0
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44
22
11
22
1.84
97540294--97540329
18
2.0
18
94
0
63
38
44
2
13
1.59
97540397--97540447
18
2.8
18
75
0
57
31
7
17
43
1.78
97542631--97543214
312
1.9
313
83
4
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30
11
11
45
1.76
97545610--97545642
3
11.0
3
100
0
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66
0
0
33
0.92
97547596--97547697
48
2.1
48
100
0
204
22
3
16
56
1.56
97553031--97553185
77
2.0
77
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0
301
54
2
11
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1.50
97561352--97561464
34
3.3
34
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0
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44
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1.80
97562379--97562445
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0
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1.88
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2.2
38
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2
130
15
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28
32
1.95
97563300--97563463
41
4.1
41
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2
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20
23
24
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1.98
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21
2.0
21
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9
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31
4
19
43
1.72
97566817--97566991
49
3.5
49
85
3
251
29
27
18
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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0
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27
19
24
1.99
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22
2.0
22
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25
25
13
36
1.92
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2.9
40
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8
128
34
24
14
26
1.94
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21
2.4
20
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0
28
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0
32
0
67
0.91
97570953--97571002
25
2.0
25
84
7
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0
28
4
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1.08
97571014--97571041
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2.3
12
100
0
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0
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0.95
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6
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1.10
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2.7
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0
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0
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0
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0
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19
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27
1.95
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2.2
23
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0
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19
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2
18.0
2
94
5
63
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
1
41
1.07
97627015--97627086
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2.9
25
85
8
94
56
0
1
41
1.07
97631554--97631672
47
2.5
48
76
14
115
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28
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2.1
26
96
0
99
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14
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26
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25
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12
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47
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19
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1.9
18
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44
0
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2.2
27
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2
0
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19
2.4
19
82
10
58
43
2
0
54
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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