Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  318  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2.0
23
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3.0
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33
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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30
1.96
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18
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2
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2.2
29
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74
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1
66
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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3.2
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11
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
15
28
1.94
103631072--103631417
128
2.7
127
83
6
394
36
20
15
27
1.92
103631292--103631473
75
2.5
74
88
3
260
30
21
14
32
1.94
103630870--103631711
423
1.9
426
89
6
1302
33
21
16
28
1.95
103631495--103631731
73
3.2
73
85
3
312
34
21
16
27
1.95
103631718--103631745
14
2.0
14
100
0
56
57
7
21
14
1.61
103631637--103631803
91
1.8
90
88
6
257
34
20
17
27
1.95
103631292--103631948
238
2.8
238
94
0
1118
32
21
17
28
1.96
103631766--103632020
73
3.5
73
91
1
413
31
20
17
30
1.96
103631733--103632020
145
2.0
147
88
3
438
32
20
18
28
1.96
103632080--103633478
699
2.0
699
99
0
2780
27
19
17
35
1.94
103641010--103641045
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
103642619--103642666
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
103642615--103642670
24
2.3
24
81
6
69
66
1
1
30
1.12
103642615--103642666
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
103642819--103642883
25
2.8
24
83
6
80
52
6
7
33
1.55
103642904--103643033
23
5.6
24
73
14
94
56
3
4
35
1.35
103643563--103643663
30
3.4
30
88
2
159
20
3
46
28
1.69
103643519--103643663
60
2.4
61
86
4
188
22
4
46
27
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103647459--103647611
32
4.8
32
86
0
225
46
9
12
32
1.73
103647459--103647611
64
2.4
64
92
0
252
46
9
12
32
1.73
103649866--103649901
19
1.9
19
94
5
65
38
13
19
27
1.90
103650127--103650261
61
2.2
61
91
0
216
48
16
12
22
1.80
103652354--103652406
25
2.2
22
81
15
61
64
1
7
26
1.31
103652775--103652799
6
4.2
6
100
0
50
32
20
16
32
1.94
103661313--103661357
23
2.0
22
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4
54
35
2
0
62
1.08
103663289--103663313
13
1.9
13
100
0
50
80
0
12
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0.92
103664012--103664045
10
3.2
10
91
8
50
55
0
0
44
0.99
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2.1
18
85
9
51
63
0
0
36
0.95
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17
2.0
17
100
0
68
17
0
23
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1.38
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19
2.0
19
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0
58
42
13
28
15
1.85
103691533--103691580
18
2.7
18
96
0
87
47
4
2
45
1.33
103693183--103693239
30
1.9
29
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36
3
3
56
1.34
103696306--103696365
30
2.0
30
100
0
120
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36
23
1.92
103697710--103697758
11
4.5
11
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10
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0
2
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1.12
103697703--103697751
22
2.3
21
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3
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48
0
2
48
1.12
103706906--103706945
19
2.1
19
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0
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7
2
17
1.19
103721023--103721053
2
15.5
2
93
0
53
48
0
3
48
1.17
103724896--103724949
27
2.0
27
100
0
108
22
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3
37
1.72
103727301--103727361
30
2.0
32
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12
83
45
9
4
39
1.59
103730588--103730627
19
2.0
21
85
9
57
47
0
25
27
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103731532--103731610
34
2.4
34
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99
29
6
12
51
1.64
103734104--103734175
36
2.0
36
100
0
144
30
16
16
36
1.91
103743606--103743675
31
2.3
31
89
0
104
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20
10
15
1.69
103743924--103743988
21
3.1
21
93
0
112
0
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29
1.50
103744406--103744434
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2.1
14
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51
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10
0
34
1.34
103749533--103749624
9
10.2
9
81
9
107
29
0
25
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1.54
103749532--103749624
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3.4
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0
150
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6
0
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1.27
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14
19.4
14
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72
52
7
0
40
1.29
103749991--103750037
23
2.1
23
92
4
78
27
12
10
48
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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