Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  66  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20649526--20649620
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47
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1
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1.24
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121
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2.0
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20
38
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10
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22
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13
206
19
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2.3
93
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0
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20
29
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2.4
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2.0
20
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100
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16
2.0
17
88
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50
36
21
0
42
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
0
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2.1
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20768276--20768316
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2.3
18
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2.0
30
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0
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15
3.3
15
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20
50
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10
8
36
1.67
20775790--20775850
30
2.0
30
100
0
122
19
22
11
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6
6
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23
2.4
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31
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3
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1.28
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5
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1.30
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4
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26
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0
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2.1
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3
28
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22
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0
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57
0
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1.12
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55
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2.2
18
86
0
53
17
27
32
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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25
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2.0
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0
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1.52
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53
5
5
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1.45
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11
2.8
11
95
0
53
25
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61
1.42
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2.0
31
93
0
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9
34
1.74
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55
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1.65
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1.95
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81
9
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24
10
20
46
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20877387--20877476
39
2.2
41
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3
130
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4
2
40
1.33
20877577--20877642
29
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50
3
0
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1.16
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100
0
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0
0
51
1.00
20901883--20901910
5
5.6
5
100
0
56
17
0
0
82
0.68
20902549--20902651
51
2.0
51
100
0
206
40
15
17
26
1.89
20903923--20903947
12
2.1
12
100
0
50
60
0
8
32
1.26
20904454--20904487
16
2.1
16
88
0
50
41
2
20
35
1.68
20920499--20920549
20
2.7
19
73
8
59
66
0
11
21
1.23
20934396--20934434
14
2.8
14
88
7
53
38
10
17
33
1.84
20934552--20934581
15
2.0
15
100
0
60
40
6
20
33
1.78
20934948--20935004
15
3.5
15
71
17
51
49
1
1
47
1.22
20935460--20935499
19
2.1
19
100
0
80
35
32
0
32
1.58
20946060--20946341
129
2.2
132
80
7
299
35
20
19
25
1.96
20946028--20946659
132
4.8
131
77
5
483
33
18
18
28
1.95
20950103--20950906
132
6.1
132
89
2
1089
27
25
18
27
1.98
20963880--20964246
46
7.6
49
87
8
440
34
14
22
28
1.93
20963880--20964246
98
3.7
97
85
9
501
34
14
22
28
1.93
20963894--20964246
196
1.8
196
92
0
598
35
14
22
28
1.93
20964210--20964318
37
3.0
37
93
2
186
36
16
22
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20965365--20965996
132
4.8
131
75
5
458
33
18
19
28
1.96
20971875--20972056
40
4.6
40
93
2
296
25
25
23
25
2.00
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20
2.2
20
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0
52
25
2
4
68
1.20
20982440--20982473
18
1.9
18
88
5
52
32
0
11
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21
2.0
22
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4
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61
4
4
28
1.36
20987465--20987512
22
2.2
21
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3
60
64
4
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25
1.35
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0
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0
0
23
0.78
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5.0
5
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0
0
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2.5
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215
23
25
25
24
2.00
20991150--20991272
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1.9
65
98
0
237
22
26
26
23
2.00
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28
2.1
28
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0
100
30
30
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25
1.94
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4
6.2
4
100
0
50
52
24
0
24
1.48
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13
4.8
13
92
4
99
40
22
12
24
1.89
21008213--21008272
25
2.4
25
91
2
93
40
23
11
25
1.88
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13
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13
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5
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38
20
14
26
1.91
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3
19.0
3
96
0
96
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0
3
33
1.12
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2.0
17
100
0
68
5
0
41
52
1.25
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72
2.1
72
84
7
193
34
17
16
31
1.93
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127
4.1
127
95
1
924
35
20
16
28
1.94
21016048--21016643
254
2.4
252
89
6
921
35
20
16
28
1.94
21079431--21079461
16
1.9
16
93
0
53
67
0
0
32
0.91
21079946--21079972
9
3.0
9
100
0
54
88
0
11
0
0.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21080534--21080565
15
2.1
15
100
0
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18
18
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1.62
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46
7.0
46
89
0
435
21
22
14
41
1.89
21080844--21081163
138
2.3
138
90
1
489
21
22
14
41
1.89
21082800--21082832
17
1.9
17
93
0
57
0
21
0
78
0.75
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5.3
6
96
3
57
33
3
0
63
1.10
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22
2.2
22
100
0
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60
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4
18
1.51
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2.0
96
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0
290
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15
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0
0
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4
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62
1
4
31
1.23
21104875--21104940
24
2.6
25
76
19
66
57
0
7
34
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352