Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  10  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3120189--3120236
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0
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0
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2.0
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10
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2.0
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8
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1
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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1.23
3158820--3158884
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19
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3
1
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1.9
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1
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2.0
20
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2.0
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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18
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2
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17
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81
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4
10
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3242773--3242846
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2.7
27
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12
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23
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21
13
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98
3.3
95
86
7
387
30
21
13
34
1.92
3249375--3249690
144
2.2
144
94
0
560
30
22
13
34
1.92
3256070--3256103
17
2.0
17
88
0
50
47
0
0
52
1.00
3258220--3258253
16
2.1
16
100
0
68
23
47
11
17
1.81
3266229--3266268
20
2.0
20
86
13
57
60
5
0
35
1.19
3266257--3266308
22
2.3
23
83
6
63
48
0
0
51
1.00
3266288--3266317
13
2.3
13
94
0
51
66
0
0
33
0.92
3270527--3270587
11
5.4
11
74
14
52
55
3
1
39
1.26
3273432--3273474
17
2.4
19
80
11
54
9
6
6
76
1.15
3275523--3275591
32
2.1
34
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5
115
42
13
13
31
1.82
3300769--3301016
50
4.8
50
84
4
282
20
29
23
26
1.99
3300768--3301016
100
2.4
104
88
6
373
20
29
23
26
1.99
3301111--3301142
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
3301354--3301411
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3302363--3302430
22
3.0
22
79
10
84
41
19
23
16
1.90
3302407--3302463
29
1.9
29
92
3
96
43
15
19
21
1.87
3303585--3303673
7
13.3
7
71
17
55
51
1
0
47
1.08
3324681--3324713
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
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46
8.0
46
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1
491
21
23
14
41
1.89
3324999--3325358
138
2.6
138
90
2
546
21
23
14
41
1.89
3326042--3326607
280
2.0
280
99
0
1114
34
18
6
41
1.75
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23
2.5
21
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17
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3
1
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1.24
3328518--3328570
20
2.4
21
84
15
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62
3
1
32
1.24
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17
3.4
17
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22
54
55
5
1
38
1.32
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2.1
27
100
0
116
37
10
27
24
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23
2.0
23
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0
74
36
2
10
50
1.50
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19
2.1
20
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4
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51
2
0
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1.14
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21
1.9
22
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5
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68
4
0
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1.10
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11
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0
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1.63
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24
2.0
25
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0
25
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5.0
9
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5
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0
9
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13
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13
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0
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68
0
5
26
1.11
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5
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5
75
19
51
69
0
11
19
1.18
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15
3.3
15
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2
62
37
2
12
47
1.53
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23
2.5
23
100
0
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6
3
43
46
1.47
3357671--3357711
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3361970--3362002
13
2.5
13
95
0
57
75
0
9
15
1.03
3362341--3362385
15
3.1
15
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3
56
35
2
13
48
1.54
3362881--3362938
23
2.5
23
100
0
116
6
3
43
46
1.47
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19
2.2
19
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46
0
24
29
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2.3
40
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6
133
27
26
15
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1.96
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48
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28
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2.3
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0
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81
2.0
81
93
0
279
23
25
14
36
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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