Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  229  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75269093--75269161
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35
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20
1.96
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1.96
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2.0
272
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3.7
35
86
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168
28
15
22
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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75302819--75303390
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6.2
93
92
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29
29
8
32
1.88
75302819--75303390
140
4.1
140
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29
29
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32
1.88
75303247--75303376
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3.1
40
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0
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1.9
173
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62
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22
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1.40
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2.2
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75342189--75342237
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2.3
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2
2
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2.0
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9
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1.8
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92
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28
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1.99
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28
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21
1.98
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163
2.0
163
98
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0
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16
87
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0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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0
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1.16
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11.6
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21
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34
0
3
62
1.13
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2.0
20
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27
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28
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41
2.0
41
100
0
166
31
16
12
39
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75412880--75413095
107
2.0
108
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0
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0
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25
45
0
30
1.54
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16
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0
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1.15
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57
80
10
127
43
6
4
45
1.49
75439851--75439972
61
2.0
61
95
0
217
30
15
5
48
1.68
75443833--75443899
34
2.0
34
93
0
116
14
19
22
43
1.87
75444433--75444560
48
2.7
46
79
11
152
25
29
16
28
1.97
75451946--75452166
47
4.7
46
76
11
159
23
29
19
27
1.98
75452001--75452216
46
4.6
46
79
10
208
21
29
20
28
1.98
75452041--75452216
94
1.9
92
85
9
241
21
28
21
27
1.99
75451946--75452211
140
1.9
141
82
5
342
22
28
19
28
1.98
75463052--75463081
9
3.4
9
95
4
53
6
10
20
63
1.47
75466584--75466800
40
5.5
40
86
3
271
25
29
23
22
1.99
75470454--75470532
37
2.1
37
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4
115
25
30
18
25
1.98
75470651--75470951
47
6.4
47
96
0
557
29
30
7
31
1.86
75478340--75478402
15
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15
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0
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52
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17
17
1.75
75500185--75500291
43
2.5
43
83
1
135
33
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14
29
1.94
75521853--75521959
43
2.5
43
81
4
119
33
14
23
28
1.93
75529155--75529196
16
2.6
16
88
0
57
50
16
21
11
1.77
75529456--75529533
29
2.7
29
80
2
77
32
10
32
25
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75529541--75529575
17
2.1
17
100
0
70
11
0
48
40
1.39
75537898--75538042
7
20.3
7
65
20
52
55
1
4
38
1.30
75537898--75538037
19
7.6
19
67
19
66
55
1
4
38
1.28
75537876--75537989
57
2.0
56
80
13
126
59
0
6
33
1.28
75539540--75540003
44
10.5
44
89
0
660
27
25
14
32
1.95
75555213--75555346
29
4.7
29
82
3
139
26
13
34
25
1.93
75555221--75555347
57
2.2
57
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5
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28
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1.92
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3.1
36
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1.96
75557560--75557716
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24
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1.97
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20
2.3
20
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0
58
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2
27
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1.68
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2.0
27
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0
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16
1.91
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25
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10
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5
29
32
1.79
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47
5.9
47
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1
439
31
9
29
29
1.88
75572864--75573141
96
2.9
95
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2
452
31
9
29
29
1.88
75572867--75573141
143
1.9
143
92
0
460
31
9
30
29
1.89
75574787--75574860
29
2.6
29
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4
105
25
16
32
25
1.96
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40
5.6
40
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5
313
25
21
26
26
2.00
75578857--75579181
47
6.9
47
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1
533
32
8
29
29
1.87
75586681--75586741
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
75589665--75589723
25
2.4
22
76
20
55
49
0
6
44
1.29
75594466--75594718
68
3.9
64
77
10
219
30
16
28
25
1.96
75614118--75614197
31
2.5
31
89
2
115
21
25
18
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75614282--75614551
27
10.0
27
80
7
201
31
8
19
40
1.81
75614365--75614546
81
2.3
79
84
6
240
30
7
19
42
1.79
75614291--75614546
54
4.7
53
79
8
230
31
8
18
41
1.80
75614540--75614668
27
4.8
27
85
0
132
41
7
20
30
1.81
75618419--75618498
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2.5
31
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2
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21
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1.96
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2.9
47
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1
159
29
22
22
24
1.99
75618688--75618857
70
2.4
71
84
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211
28
22
21
28
1.99
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23
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21
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1.99
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3.3
20
91
0
107
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22
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1.90
75620215--75620279
27
2.4
27
82
5
78
21
24
18
35
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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