Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  245  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81241753--81241867
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0
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0
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19
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139
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19
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23
1.98
81245188--81245495
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288
29
19
27
23
1.98
81250317--81250371
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2.2
25
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177
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29
29
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227
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2.00
81275407--81275590
40
4.6
40
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9
207
25
22
27
24
2.00
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201
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17
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56
2
2
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1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
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2.2
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2.0
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68
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3.7
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2.3
23
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12
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1
0
39
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81296612--81296698
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0
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44
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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32
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28
30
1.96
81360187--81360358
24
6.8
24
70
14
107
61
4
5
29
1.37
81360157--81360358
25
8.0
25
70
13
130
59
5
5
29
1.42
81360283--81360359
26
2.9
27
83
11
97
63
1
3
31
1.20
81361927--81362137
45
4.8
44
70
11
169
26
25
21
27
1.99
81361876--81362238
134
2.6
139
85
5
470
26
23
20
29
1.99
81361881--81362375
45
10.9
44
66
11
156
26
22
20
29
1.99
81361996--81362285
143
2.0
143
83
2
359
28
22
19
30
1.98
81362774--81362855
42
2.0
42
97
0
155
26
14
18
40
1.89
81363292--81363383
26
3.5
27
68
20
77
55
4
16
23
1.59
81363240--81363392
53
2.9
53
93
0
252
56
5
15
22
1.61
81369652--81369828
26
7.0
25
73
13
141
61
3
5
30
1.34
81369626--81369828
52
4.0
49
75
11
146
60
3
4
31
1.35
81375065--81375120
29
1.9
29
85
7
78
42
10
10
35
1.74
81375837--81375884
18
2.7
18
81
15
55
62
2
4
31
1.26
81377868--81378023
70
2.2
69
88
1
222
47
17
8
26
1.76
81378132--81378592
161
2.9
157
74
8
430
33
14
16
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81380953--81381068
39
2.9
39
87
3
153
25
48
4
22
1.69
81380998--81381109
33
3.2
34
77
15
129
28
44
4
22
1.72
81381620--81381721
48
2.1
47
80
8
116
47
20
7
24
1.77
81383269--81383366
43
2.3
43
83
0
133
20
36
27
15
1.93
81399423--81399515
22
4.3
21
72
11
73
17
27
34
20
1.95
81399425--81399515
43
2.1
43
85
0
119
17
28
32
20
1.96
81401327--81401373
19
2.5
19
92
0
76
10
42
19
27
1.84
81402804--81402983
48
3.8
48
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5
168
27
28
17
26
1.98
81413970--81414083
41
2.8
41
81
13
137
21
18
21
37
1.94
81428097--81428204
6
17.7
6
68
6
65
70
3
19
6
1.25
81428101--81428159
18
3.3
18
80
0
73
71
6
16
5
1.26
81428165--81428202
13
2.8
13
82
17
51
73
0
18
7
1.06
81428166--81428216
21
2.4
21
74
6
50
74
1
17
5
1.11
81428118--81428222
27
3.8
27
71
9
77
68
2
20
8
1.29
81428219--81428281
33
1.9
33
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12
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53
6
26
12
1.62
81433567--81433619
24
2.2
24
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12
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32
37
15
15
1.88
81435155--81435260
41
2.6
40
83
5
133
21
20
23
33
1.97
81447858--81447915
28
2.1
28
90
0
89
27
29
8
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1.87
81447863--81447939
28
2.8
26
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11
82
25
28
12
32
1.93
81457038--81457071
17
1.9
18
94
5
61
23
2
5
67
1.26
81457038--81457073
9
4.0
9
89
10
56
22
2
8
66
1.31
81457248--81457529
148
1.9
147
94
0
501
39
19
16
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81463134--81463207
27
2.8
26
85
6
87
45
14
12
27
1.80
81467770--81467895
47
2.7
48
81
6
134
25
30
15
27
1.96
81476703--81476740
20
1.9
20
88
0
58
26
34
23
15
1.95
81482513--81482545
16
2.1
16
100
0
66
30
21
6
42
1.77
81497254--81497290
17
2.2
17
100
0
74
16
21
24
37
1.93
81506809--81506837
9
3.2
9
100
0
58
0
41
0
58
0.98
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83
2.1
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90
6
279
45
23
15
15
1.84
81509149--81509250
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2.0
51
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0
195
19
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1.93
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2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
81519804--81519884
39
2.1
39
97
0
153
16
17
23
43
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352