Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  319  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103752669--103752700
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13
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18
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
1.80
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2.3
220
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2.8
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150
37
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16
35
1.82
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161
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1.83
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2.1
18
100
0
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10
39
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.9
210
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2.0
26
92
0
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17
19
23
39
1.92
103876343--103876950
210
2.9
207
81
6
732
34
14
18
32
1.91
103885442--103885474
6
5.5
6
96
0
57
27
0
3
69
1.03
103887325--103887407
40
2.1
40
90
4
132
24
22
19
33
1.97
103890139--103890221
40
2.1
40
90
4
132
22
24
20
32
1.98
103898876--103899281
210
1.9
210
87
2
591
31
14
21
32
1.93
103903951--103904003
24
2.2
24
96
0
97
43
3
3
49
1.38
103904677--103904718
14
2.9
15
78
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50
45
0
2
52
1.13
103907033--103907078
21
2.2
21
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0
83
30
23
45
0
1.53
103909024--103909085
32
1.9
31
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12
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58
12
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24
1.54
103913720--103913753
18
1.9
18
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5
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2
8
26
1.40
103914450--103914499
10
4.9
11
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16
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2
10
22
1.32
103917710--103917949
132
1.8
132
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1
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25
18
19
36
1.94
103932035--103932657
210
3.0
209
88
1
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33
14
20
31
1.92
103935038--103935071
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0
0
76
0.79
103935641--103935912
148
1.8
148
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4
352
35
20
11
32
1.89
103937271--103937316
19
2.4
19
85
7
58
47
13
19
19
1.81
103939614--103939732
6
20.5
6
76
13
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58
1
8
31
1.37
103939636--103939734
3
33.3
3
82
6
121
61
1
5
32
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103939599--103939732
9
15.2
9
79
13
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58
1
8
32
1.37
103939814--103939862
17
2.8
18
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65
2
2
30
1.15
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12
4.4
11
83
13
59
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1
3
26
1.18
103940236--103940294
15
4.1
15
74
12
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66
3
5
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1.28
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1.9
15
100
0
58
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1.75
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6
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6
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0
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18
0
0
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0
0
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103945039--103945126
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5
17
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0
2
18
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3.2
128
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4
478
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18
28
1.94
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1
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2
104
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0
7
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1.30
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1.92
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18
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18
100
0
70
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17
34
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210
2.6
210
90
0
865
34
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19
32
1.91
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210
2.9
209
87
1
831
33
14
19
32
1.92
103987543--103987609
35
1.9
35
90
6
109
34
2
8
53
1.47
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10
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2
8
18
1.25
103999805--104000210
210
1.9
210
83
1
517
33
14
21
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
104000451--104000501
25
2.0
25
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0
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5
15
37
1.72
104000454--104000501
12
3.9
12
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41
4
16
37
1.68
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12
4.1
13
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16
54
41
3
17
37
1.68
104005124--104005172
25
2.0
25
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0
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4
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38
1.70
104009337--104009502
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20
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2.3
18
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0
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2
0
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347
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18
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29
1.98
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2.0
203
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0
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1.91
104022378--104022543
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2.0
83
100
0
332
32
15
22
28
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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