Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  92  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29163612--29163996
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29163860--29164513
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16
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1.96
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2.4
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0
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34
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
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(0-2)
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22
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1.97
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5
6
31
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.3
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4
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1.42
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11
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6
34
1.44
29312520--29312565
25
1.9
25
86
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69
60
0
4
34
1.16
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17
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1.96
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1.01
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0
0
24
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29358178--29358251
29
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16
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1
0
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1.04
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30
2.5
31
76
17
74
62
1
0
36
1.04
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19
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2
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1.34
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228
2.1
228
95
0
842
23
20
29
25
1.99
29373776--29374030
55
4.8
54
75
12
219
35
17
24
22
1.95
29373783--29373983
108
1.8
110
86
6
293
33
17
24
23
1.96
29375077--29375235
27
5.9
27
79
10
173
33
22
25
18
1.96
29375077--29375238
54
3.0
54
88
2
229
33
22
25
18
1.96
29376860--29376937
26
3.0
26
94
0
129
35
21
7
34
1.82
29377310--29377340
16
1.9
16
93
0
53
41
0
22
35
1.54
29379644--29379731
43
2.0
43
97
0
167
23
19
10
46
1.80
29385183--29385216
18
1.9
17
88
5
50
29
0
5
64
1.17
29385210--29385271
29
2.1
31
82
11
76
48
0
8
43
1.32
29386416--29386463
24
2.0
24
95
0
87
47
12
0
39
1.41
29386751--29386790
11
3.6
11
86
0
62
22
7
7
62
1.47
29386742--29386791
22
2.3
23
75
10
59
20
10
8
62
1.52
29387637--29387670
16
2.1
16
100
0
68
29
5
23
41
1.78
29392094--29392142
21
2.3
21
82
10
55
69
4
10
16
1.32
29393851--29393888
20
1.9
20
84
10
51
44
7
5
42
1.56
29394691--29394723
8
4.1
8
100
0
66
51
12
0
36
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29397217--29397254
17
2.2
17
86
9
51
44
0
5
50
1.24
29398088--29398154
32
2.2
30
89
5
98
59
13
2
23
1.48
29399155--29399267
57
2.0
57
98
0
217
33
13
17
35
1.89
29400614--29400655
21
2.0
22
90
4
68
64
4
2
28
1.26
29400605--29400662
21
2.6
22
79
17
66
67
3
1
27
1.17
29400737--29400794
25
2.4
24
85
8
82
67
1
1
29
1.11
29400817--29400941
26
5.0
24
70
17
87
60
2
4
33
1.29
29402674--29402885
44
4.8
44
78
1
183
29
19
18
32
1.96
29403039--29403160
44
2.8
45
76
6
124
31
18
18
31
1.96
29406992--29407308
160
2.0
156
88
4
476
39
5
10
43
1.64
29407961--29408132
92
1.9
92
83
2
229
34
9
11
43
1.74
29408207--29408240
11
2.9
12
86
8
52
64
0
5
29
1.17
29416161--29416239
37
2.1
37
90
0
122
25
31
18
24
1.98
29416357--29416720
47
7.7
47
96
0
665
29
30
9
31
1.88
29416513--29416588
22
3.3
22
64
10
62
28
28
11
30
1.92
29416607--29416682
22
3.3
22
64
10
62
28
31
10
28
1.90
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40
5.9
40
79
5
210
24
28
22
24
2.00
29420767--29420845
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
29420827--29420929
43
2.4
43
100
0
206
26
35
15
22
1.94
29422793--29422871
37
2.1
37
90
0
122
25
31
18
24
1.98
29422989--29423305
47
6.7
47
98
1
598
29
30
8
31
1.88
29430978--29431051
29
2.6
29
86
4
96
25
31
16
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29439078--29439151
29
2.6
29
86
4
96
25
31
16
27
1.96
29442974--29443098
62
2.0
62
96
0
232
26
12
24
37
1.90
29451410--29451515
55
1.9
55
86
0
149
26
25
29
18
1.98
29454019--29454206
49
3.8
49
83
2
250
26
18
26
28
1.98
29454014--29454201
100
1.9
100
96
0
349
25
19
26
28
1.99
29457177--29457241
15
4.4
15
74
16
64
7
12
15
64
1.48
29457172--29457241
30
2.4
30
79
15
83
7
11
18
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1.50
29459240--29459427
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49
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5
234
26
17
26
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1.97
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100
1.9
100
93
0
322
25
18
26
30
1.98
29469673--29469762
22
4.1
23
77
13
93
36
18
21
23
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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