Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  56  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17959772--17959803
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0
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0
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1.01
17992320--17992379
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12
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1
0
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0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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76
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0
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54
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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16
86
55
0
1
43
1.07
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4.3
22
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52
0
0
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1.00
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18047818--18047970
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1.94
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3.1
74
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8
312
32
22
15
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18050152--18050179
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2.0
14
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57
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14
1.61
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243
36
19
18
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1.94
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14
2.5
14
95
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60
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16
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2.0
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4
234
38
23
15
22
1.92
18050420--18050709
160
1.8
157
85
6
406
34
22
15
27
1.94
18050938--18051170
76
3.1
76
87
7
343
30
20
15
33
1.94
18051208--18051383
71
2.5
70
85
3
212
34
22
14
28
1.94
18059800--18059837
19
2.0
20
89
5
60
52
5
10
31
1.58
18059870--18059955
34
2.4
36
81
9
88
56
3
4
34
1.37
18059833--18060004
83
2.1
83
79
8
181
54
4
6
34
1.47
18059909--18060034
23
5.5
21
70
21
60
56
3
4
35
1.36
18060527--18060689
30
5.4
30
90
0
263
23
3
47
25
1.66
18060527--18060691
60
2.8
60
97
0
303
24
3
47
24
1.66
18064003--18064047
23
2.1
21
84
15
58
55
0
6
37
1.26
18064030--18064074
21
2.1
21
84
8
56
60
4
4
31
1.37
18067428--18067475
22
2.2
22
88
0
69
22
33
14
29
1.94
18067450--18067595
47
3.1
47
91
0
229
26
29
10
32
1.91
18075061--18075100
21
1.9
21
84
0
53
32
12
15
40
1.84
18081683--18081756
23
3.3
23
72
11
62
40
21
16
21
1.91
18082195--18082246
27
1.9
27
92
0
86
26
30
19
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18082237--18082278
15
2.7
15
88
3
57
21
21
30
26
1.98
18082312--18082354
14
2.9
15
83
13
54
30
23
13
32
1.93
18082719--18082816
46
2.1
47
88
1
144
46
14
15
23
1.82
18086293--18086560
147
1.8
147
82
4
344
33
3
17
45
1.66
18086957--18087000
17
2.7
15
83
13
52
54
15
4
25
1.60
18087025--18087051
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
18092878--18092921
22
2.1
20
91
8
70
38
0
15
45
1.47
18092838--18093147
159
1.9
159
88
2
462
36
1
17
44
1.59
18093145--18093587
126
3.5
126
91
0
706
37
17
17
27
1.93
18095484--18095731
50
4.8
50
84
5
275
20
29
24
26
1.99
18095483--18095731
100
2.4
104
87
7
348
20
28
24
26
1.99
18095826--18095857
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
18096069--18096126
30
1.9
30
85
0
80
31
22
3
43
1.70
18103446--18103475
9
3.4
9
90
9
53
63
0
0
36
0.95
18103653--18103694
21
2.0
21
90
0
66
4
16
45
33
1.69
18104027--18104095
30
2.3
30
84
0
102
8
20
42
28
1.82
18106366--18106426
11
5.5
11
77
14
56
68
3
0
27
1.05
18106431--18106462
4
8.0
4
100
0
64
50
0
0
50
1.00
18107293--18108531
616
2.0
615
95
0
2244
30
23
17
28
1.97
18109843--18109901
29
2.0
29
100
0
118
45
16
3
33
1.64
18110391--18110451
31
2.0
31
83
6
79
39
8
8
44
1.64
18118546--18118599
23
2.5
23
82
8
60
61
7
0
31
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18118609--18118670
25
2.5
24
75
12
63
59
0
8
32
1.26
18118773--18118839
21
3.0
23
76
21
72
64
0
5
29
1.17
18118800--18118886
44
2.0
44
82
13
108
65
0
8
26
1.20
18118798--18118926
15
8.9
14
72
18
70
65
1
6
25
1.26
18118819--18118926
29
3.8
28
73
22
73
64
1
7
25
1.30
18122100--18122234
52
2.6
52
82
5
173
28
14
25
31
1.94
18122100--18122297
52
3.9
51
77
10
158
28
14
24
32
1.95
18122152--18122337
47
3.9
47
75
11
128
29
13
24
32
1.94
18123141--18123165
13
1.9
13
100
0
50
16
16
40
28
1.89
18124680--18124710
14
2.2
14
94
0
53
83
0
12
3
0.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352