Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  18  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5742565--5743231
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2.6
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.1
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29
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19
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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28
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19
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0
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
0
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26
20
23
1.99
5942581--5942610
13
2.4
13
94
5
53
70
0
0
30
0.88
5946068--5946125
11
5.1
11
79
8
53
17
5
12
65
1.43
5946797--5946850
24
2.2
26
80
10
67
55
0
3
40
1.17
5946801--5946865
24
2.8
25
79
9
66
56
0
4
38
1.20
5947893--5947921
9
3.2
9
100
0
58
51
0
0
48
1.00
5947901--5947950
24
2.0
27
84
11
70
50
0
0
50
1.00
5962028--5962062
15
2.3
15
85
0
52
60
2
0
37
1.12
5964041--5964078
14
2.7
14
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12
60
57
0
0
42
0.98
5964761--5964798
18
2.1
19
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5
60
39
0
0
60
0.97
5966046--5966120
31
2.4
31
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0
78
52
12
4
32
1.57
5977514--5977764
132
1.9
132
85
3
353
29
17
22
30
1.97
5977646--5977981
150
2.2
150
83
3
399
27
19
20
32
1.97
5979172--5979210
14
2.8
14
84
0
51
5
15
0
79
0.90
5981571--5981636
5
14.0
5
70
12
50
56
0
4
39
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5981548--5981636
10
9.2
10
72
9
51
58
1
4
35
1.26
5981566--5981637
22
3.1
22
80
6
72
58
0
4
37
1.18
5984473--5984534
28
2.2
29
85
2
81
51
1
3
43
1.27
5984509--5984568
20
2.8
22
76
19
65
41
3
3
51
1.35
5987614--5987648
16
2.1
17
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5
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60
0
0
40
0.97
5987613--5987702
9
9.8
9
69
17
51
54
4
0
41
1.20
5987666--5987703
20
1.9
20
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0
58
57
5
0
36
1.21
5988852--5988887
16
2.2
16
100
0
72
33
19
27
19
1.96
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32
2.1
32
97
0
125
40
11
19
28
1.87
5998340--5998392
23
2.3
23
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0
97
50
20
9
18
1.74
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5
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5
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6
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38
0
0
61
0.96
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2.0
30
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59
6
33
0
1.23
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2.1
22
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0
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0
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1.45
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13
3.0
14
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7
57
31
0
2
65
1.05
6007873--6007918
13
3.5
13
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36
0
2
60
1.09
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2.0
23
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0
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0
6
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1.27
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29
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9
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40
0
0
60
0.97
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17
2.5
16
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11
57
33
0
0
66
0.92
6013921--6013984
23
2.8
24
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7
69
37
0
3
59
1.13
6020226--6020255
8
3.8
8
90
0
51
23
0
0
76
0.78
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102
2.8
100
81
11
305
29
5
5
59
1.43
6021312--6021464
75
2.1
74
82
4
184
29
5
5
59
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6021276--6021518
26
9.5
25
75
11
199
29
6
4
59
1.43
6021276--6021518
50
4.7
52
78
9
239
29
6
4
59
1.43
6042147--6042331
96
1.9
96
86
2
264
22
16
35
25
1.95
6046307--6046347
17
2.6
16
85
11
57
12
7
4
75
1.16
6046962--6047015
24
2.2
24
84
12
67
37
1
0
61
1.07
6050478--6050511
17
2.0
17
94
0
59
44
0
2
52
1.16
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2.4
22
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0
1
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11
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0
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1.35
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22
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0
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1.45
6053766--6053947
91
2.0
91
90
0
283
30
16
15
36
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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