Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  308  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100707171--100707233
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20
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
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5
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4
16
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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77
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5
14
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100857899--100857961
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56
1.16
100870221--100870269
13
4.4
12
72
27
54
38
0
0
61
0.96
100870175--100870279
32
3.2
32
84
11
131
39
0
0
59
1.11
100870241--100870306
22
3.1
21
87
8
89
46
0
0
53
1.00
100870235--100870325
19
4.7
18
75
17
60
46
0
0
53
1.00
100870330--100870371
20
2.1
20
95
0
75
26
4
7
61
1.42
100870349--100870423
31
2.6
28
82
15
98
34
1
2
61
1.18
100870378--100870417
21
1.9
21
85
10
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35
0
2
62
1.09
100870370--100870433
31
2.1
30
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11
69
37
0
1
60
1.06
100870478--100870531
21
2.5
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78
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0
1
33
1.04
100870584--100870619
7
5.3
7
93
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69
0
0
30
0.89
100870588--100870617
13
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13
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0
60
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0
0
26
0.84
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0
0
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20
2.8
20
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10
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0
0
37
0.95
100871172--100871293
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3
42
1.27
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17
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0
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0
3
51
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100886032--100886304
46
5.9
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1
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22
20
1.89
100890261--100890333
29
2.5
27
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18
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53
0
0
46
1.00
100890335--100890500
90
1.8
90
87
8
248
51
5
3
39
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100890482--100890520
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2.0
20
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10
53
51
2
0
46
1.14
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21
2.5
20
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0
0
36
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31
2.0
32
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8
105
65
0
1
32
1.02
100890509--100890600
32
2.8
30
77
14
85
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0
1
36
1.03
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16
2.3
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59
0
0
40
0.97
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15
3.5
15
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50
1
0
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0
2
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0
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0
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30
1.84
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22
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20
1.38
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2.1
39
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2.0
20
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2
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2.0
19
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0
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10
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44
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31
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21
1.96
100918735--100919300
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3.3
173
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31
17
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21
1.96
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25
4
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63
1.38
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24
2.4
24
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0
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26
3
8
61
1.42
100921012--100921041
12
2.5
12
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0
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40
0
10
50
1.36
100921099--100921175
23
3.2
23
78
21
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1
2
58
1.20
100921095--100921155
16
3.9
16
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14
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37
1
4
55
1.31
100921104--100921172
25
2.8
23
78
22
70
37
1
2
57
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100921378--100921422
3
15.0
3
95
0
81
31
0
2
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1.04
100921725--100921965
133
1.8
133
87
0
365
23
18
21
36
1.94
100937656--100937750
29
3.2
28
78
15
95
29
9
0
61
1.28
100937856--100937904
25
2.0
25
84
8
64
30
8
2
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1.38
100938203--100938236
17
1.9
18
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52
32
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47
1.71
100950409--100950455
24
2.0
24
86
0
67
55
19
12
12
1.69
100956408--100956501
31
3.2
31
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115
23
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11
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1.80
100956408--100956669
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306
25
19
10
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1.82
100956438--100956660
119
1.9
117
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324
27
19
8
43
1.81
100957935--100957984
19
2.6
19
78
9
57
34
14
16
36
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352