Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  277  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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90777302--90777374
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2.0
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28
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0
16
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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26
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11
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491
28
15
28
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1.96
90841206--90841606
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177
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332
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8
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11
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18
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1.9
131
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340
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19
17
32
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.99
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590
24
27
21
26
1.99
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2.0
24
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27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.99
90913182--90913701
221
2.4
221
92
0
869
25
23
21
30
1.99
90913400--90913609
84
2.5
84
92
1
350
25
22
20
30
1.98
90913263--90913525
137
1.9
137
95
1
474
23
22
22
31
1.99
90914655--90914697
18
2.5
17
85
7
59
11
4
0
83
0.78
90921220--90921299
19
4.3
19
85
6
119
37
17
10
35
1.83
90921608--90921654
20
2.5
20
89
6
71
72
8
2
17
1.19
90922559--90922631
19
3.9
18
76
18
69
34
6
0
58
1.24
90924207--90924251
19
2.3
20
84
3
56
53
2
6
37
1.40
90924176--90924251
10
7.5
10
69
18
50
47
2
10
39
1.52
90950754--90950807
17
2.9
19
83
10
85
37
11
14
37
1.82
90950756--90950813
17
3.3
17
73
22
57
37
10
15
36
1.82
90951097--90951130
17
2.0
17
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11
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32
0
0
67
0.91
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19
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0
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10
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1.83
90956331--90956372
19
2.3
19
88
8
61
38
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14
35
1.83
90956483--90956522
21
2.0
20
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5
53
10
2
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72
1.21
90956623--90956656
17
2.0
17
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32
0
0
67
0.91
90959693--90959863
66
2.6
66
80
5
168
32
11
24
30
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90959752--90959857
36
3.1
36
75
18
118
26
12
29
32
1.92
90965280--90965473
47
4.1
47
89
1
273
32
11
28
26
1.91
90965354--90965429
23
3.2
25
62
24
63
28
13
34
23
1.92
90965444--90965627
98
1.9
96
92
4
307
35
7
26
30
1.84
90965443--90965627
48
3.8
48
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300
35
7
26
30
1.84
90965774--90965881
37
2.9
37
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0
180
23
18
31
26
1.97
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31
2.0
31
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0
104
22
6
22
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1.74
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39
3.7
39
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25
27
23
23
2.00
90980946--90981107
78
2.1
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7
175
25
27
22
24
2.00
90980984--90981107
39
3.2
38
90
2
187
25
28
21
24
1.99
90983690--90983722
16
2.1
16
94
0
57
39
39
6
15
1.72
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2.0
66
80
0
151
27
15
24
32
1.96
90986744--90986789
20
2.4
20
89
7
69
73
6
2
17
1.14
90989671--90989823
35
4.3
35
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2
252
37
14
11
37
1.82
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207
3.8
207
94
0
1338
29
22
17
30
1.97
90991020--90991304
84
3.4
82
81
9
315
23
20
24
31
1.98
90991060--90991307
87
2.9
83
85
4
334
22
20
25
31
1.98
90991158--90991297
43
3.3
42
72
7
131
22
20
24
32
1.97
90992255--90992310
21
2.7
20
89
10
85
3
12
0
83
0.76
90992262--90992312
16
3.4
15
81
7
50
3
11
0
84
0.75
90998062--90998196
17
7.6
17
81
11
155
37
13
10
38
1.79
90998062--90998196
35
3.8
36
92
3
195
37
13
10
38
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90998083--90998212
35
3.7
35
89
5
147
37
13
10
37
1.80
90998849--90998906
30
1.9
30
82
6
73
22
13
6
56
1.61
90999065--90999121
29
2.0
29
92
0
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33
0
0
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0.92
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17
12.4
17
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19
80
36
1
0
61
1.13
90999176--90999322
7
19.7
7
72
19
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34
1
0
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1.08
90999155--90999324
5
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5
70
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1
0
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90999153--90999329
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1
1
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1.10
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1
0
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1.07
90999153--90999329
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1
1
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1.10
90999705--90999739
18
1.9
18
94
0
61
20
0
5
74
1.02

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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