Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  289  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
94940193--94940238
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2.0
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183
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1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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89
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2.9
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87
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44
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14
117
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22
18
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
38
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29
26
23
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95201421--95201497
35
2.2
35
95
0
136
38
23
16
20
1.92
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3
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6
0
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1.25
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14
19
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1.92
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19
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12
55
29
5
15
50
1.66
95222140--95222199
20
3.0
20
74
13
61
30
5
15
50
1.65
95224843--95224886
15
2.7
16
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13
63
29
6
2
61
1.34
95226100--95226142
22
2.0
22
85
0
59
55
6
13
23
1.62
95226418--95226461
22
2.0
22
100
0
88
45
27
4
22
1.72
95227267--95227430
42
3.7
42
83
8
159
29
25
13
31
1.94
95227337--95227545
49
4.2
48
75
9
181
33
26
13
26
1.93
95232740--95232791
22
2.4
22
86
0
68
65
19
7
7
1.43
95235258--95235300
22
2.0
22
100
0
86
30
13
13
41
1.84
95235780--95235837
18
3.1
18
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12
55
53
1
1
43
1.21
95235780--95235837
19
3.1
19
82
12
57
53
1
1
43
1.21
95253147--95253191
23
2.0
23
90
0
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11
22
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1.87
95253237--95253291
16
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16
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27
23
1.75
95253484--95253513
15
2.0
15
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0
51
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20
2.0
20
100
0
80
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5
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25
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95285658--95287406
917
1.9
913
84
5
2309
27
12
20
39
1.88
95295783--95295821
20
2.0
20
85
10
53
53
12
12
20
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
610
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0
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24
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29
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38
2.2
38
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2
152
49
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8
34
1.63
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17
2.0
17
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11
52
5
5
23
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1.38
95309168--95309206
18
2.2
18
86
9
53
28
20
10
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1.85
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19
2.4
19
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3
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46
8
15
28
1.76
95313494--95313740
118
2.1
118
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0
449
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1.75
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2
0
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0
0
60
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0
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30
1.75
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2.0
43
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121
48
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2
46
1.31
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1.9
18
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0
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2.0
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0
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20
1.93
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9
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15
50
1.73
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3
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0
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0
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2
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0
0
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50
0
0
1.00
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2
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6
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80
0
19
0
0.71
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2
1
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24
3.8
24
98
0
175
57
3
0
39
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95389724--95389756
16
2.1
17
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57
0
0
42
0.98
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2.0
25
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0
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5
23
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54
1.63
95393166--95393249
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2.0
41
100
0
168
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11
7
44
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2.1
27
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1
1
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1.19
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10
4
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1.61
95403292--95403355
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18
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35
14
10
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1.81
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1
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0
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1.91
95405702--95405754
26
2.0
26
100
0
106
41
11
16
30
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352