Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  253  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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20
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Indices
Period
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Copy
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1.98
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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44
27.7
44
87
2
1671
22
31
16
29
1.96
83648164--83649365
216
5.5
217
87
3
1584
22
31
16
29
1.96
83648164--83649365
260
4.6
257
88
1
1686
22
31
16
29
1.96
83649346--83649385
20
2.0
20
90
0
62
27
22
7
42
1.80
83649378--83649601
88
2.6
88
89
0
333
28
26
16
28
1.97
83649409--83649546
41
3.2
41
68
18
109
32
24
15
26
1.96
83658826--83659011
40
4.7
40
84
5
225
26
27
22
24
2.00
83666664--83666849
80
2.3
82
84
5
238
27
27
20
24
1.99
83666664--83666849
40
4.7
40
84
6
216
27
27
20
24
1.99
83672549--83672586
19
2.0
19
89
0
58
36
10
23
28
1.88
83673765--83673789
7
3.6
7
100
0
50
12
0
0
88
0.53
83678291--83678334
20
2.3
19
88
4
61
65
2
13
18
1.36
83678739--83678771
15
2.2
15
100
0
66
0
24
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69
1.10
83682806--83682867
25
2.3
25
84
15
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29
4
8
58
1.48
83683293--83683334
20
2.3
19
84
12
52
69
4
4
21
1.26
83687198--83687258
30
2.0
30
84
6
79
31
24
4
39
1.77
83691082--83691113
3
10.7
3
100
0
64
68
0
0
31
0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83693600--83693644
18
2.6
18
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13
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51
4
0
44
1.21
83693633--83693671
17
2.4
17
91
4
62
48
0
0
51
1.00
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21
2.4
23
87
12
76
49
0
0
50
1.00
83702252--83702364
52
2.2
52
96
1
208
42
15
7
34
1.75
83704453--83704498
22
2.0
23
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12
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58
0
8
32
1.28
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36
2.0
36
100
0
144
22
11
11
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1.66
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17
2.5
17
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0
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0
20
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1.53
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22
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14
26
1.93
83710433--83710653
88
2.5
88
93
0
370
31
25
15
27
1.96
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5.2
45
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7
274
25
26
18
29
1.98
83715985--83716168
40
4.6
40
82
6
196
23
20
27
28
1.99
83715985--83716165
80
2.3
81
83
9
221
23
20
27
27
1.99
83716066--83716215
40
3.8
38
80
8
122
24
22
28
24
1.99
83723878--83724062
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4.6
40
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23
21
27
28
1.99
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26
2.3
26
86
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79
27
8
27
36
1.85
83730159--83730236
27
2.7
29
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79
66
0
29
3
1.09
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15
1.9
15
100
0
58
58
0
0
41
0.98
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29
2.0
29
82
6
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61
1
3
33
1.23
83744781--83744831
18
2.7
20
76
17
54
58
7
1
31
1.37
83745187--83745255
28
2.4
28
79
13
70
60
1
5
31
1.29
83745302--83745356
24
2.3
24
84
3
67
50
5
5
38
1.48
83745412--83745459
18
2.7
17
87
6
51
66
2
2
29
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
83745610--83745707
3
32.0
3
71
17
60
59
3
5
32
1.35
83745610--83745707
21
4.6
20
72
16
74
59
3
5
32
1.35
83746856--83746922
23
2.9
23
86
4
91
22
2
37
37
1.70
83757827--83757860
13
2.6
13
90
0
50
32
29
29
8
1.87
83764150--83764201
25
2.1
25
89
3
79
28
19
21
30
1.97
83764161--83764226
25
2.6
25
90
0
96
22
21
27
28
1.99
83764271--83764306
10
3.5
10
92
7
63
30
19
16
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1.94
83765873--83765936
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2.0
32
100
0
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9
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50
2.6
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89
3
181
24
17
27
30
1.97
83781935--83782118
99
1.8
101
83
4
248
25
19
25
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352