Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  21  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6645983--6646028
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0
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9
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2.2
19
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2
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1.08
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0
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2.0
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10
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2.0
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0
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50
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2.7
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27
18
20
33
1.96
6673421--6673611
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5.0
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109
27
19
20
32
1.97
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10
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10
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0
0
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7
39
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
18
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1.9
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1.9
16
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3
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1.54
6712234--6712459
118
1.9
118
82
1
283
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5
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1.53
6712466--6712521
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2.0
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0
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13
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2
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1.9
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14
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1.97
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2.3
31
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30
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17
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1.00
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4.7
47
83
4
241
20
22
15
41
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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1.89
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4.2
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22
12
32
1.91
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2.5
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20
14
33
1.92
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2.1
40
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2
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13
2
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50
1
0
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1.12
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2.9
19
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1
0
48
1.11
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43
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0
0
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2.3
15
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0
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0
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35
1
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1
0
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3
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3
31
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190
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122
25
15
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1.96
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168
2.0
168
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4
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10
14
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0
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0
44
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6847562--6847688
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3.0
42
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6
152
29
25
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1.94
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15
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17
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28
0
5
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1.16
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28
0
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28
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1.54
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2.3
27
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10
67
20
4
34
40
1.73
6848962--6849001
19
2.2
18
86
13
55
47
0
22
30
1.52
6850227--6850365
31
4.5
31
92
3
219
25
28
17
28
1.97
6850219--6850365
62
2.4
62
93
4
244
26
27
18
27
1.98
6851202--6851265
32
2.0
31
90
3
101
39
23
9
28
1.86
6851482--6851678
41
4.8
41
92
5
317
27
22
20
28
1.99
6853210--6853234
13
1.9
13
100
0
50
68
24
0
8
1.16
6858878--6858941
33
2.0
32
90
3
101
39
25
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1.86
6859156--6859351
41
4.8
41
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6
308
28
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20
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1.98
6859156--6859351
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4
306
28
21
20
29
1.98
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0
2
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1.08
6867103--6867255
75
2.0
76
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38
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38
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52
0
0
47
1.00
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2
21.0
2
100
0
84
0
0
50
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6878737--6878770
6
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6
100
0
68
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50
17
17
1.79
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21
2.2
22
92
3
78
21
19
38
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1.94
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16
4.4
16
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0
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31
1
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31
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44
2.1
44
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1
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31
6
27
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2.1
17
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0
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0
0
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2.0
120
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5
1
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1.32
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2.0
17
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0
0
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0.99
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13
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46
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27
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25
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20
22
20
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25
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25
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20
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1.97
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90
20
26
20
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1.97
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0
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0
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2
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54
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0
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3
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1.29
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3.1
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6
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15
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14
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21
18
30
1.97
6923265--6923803
129
4.2
129
96
0
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28
21
18
30
1.97
6923349--6923803
85
5.3
85
73
11
291
28
21
18
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6936153--6936268
11
9.8
12
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21
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0
29
0
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0.94
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4
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4
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0
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0
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7
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0
28
0
70
0.94
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1
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21
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1
29
2
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0
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0
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0
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0
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18
2.2
18
95
0
71
17
25
20
37
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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