Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  303  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99319727--99319791
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50
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2.1
16
88
0
50
50
14
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17
1.79
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18
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99340694--99340728
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25
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132
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24
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1.98
99345166--99346168
264
3.8
263
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1240
26
25
18
30
1.98
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1.9
205
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2.0
166
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1
503
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21
17
31
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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371
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1.96
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205
1.8
205
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1
579
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2.0
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17
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2
0
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4.6
46
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52
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99357852--99357942
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99357852--99357942
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2.3
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1.27
99366284--99366338
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2.1
26
90
6
85
63
5
3
27
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.02
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0
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92
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1.51
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0
57
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15
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99426814--99426868
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22
2.0
24
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69
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13
8
43
1.74
99440141--99440189
20
2.5
20
93
0
80
40
8
4
46
1.52
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5.0
6
100
0
60
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0
0
16
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2.2
55
85
0
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13
30
31
24
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127
4.0
127
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40
18
15
26
1.90
99455679--99456118
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127
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3
555
40
18
15
25
1.89
99459040--99459064
11
2.3
11
100
0
50
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28
1.85
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32
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0
128
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31
18
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99467384--99467548
78
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78
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7
176
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22
22
1.99
99467437--99467548
39
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39
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0
179
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28
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22
1.98
99476579--99476611
5
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23
2.0
23
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1.72
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2.5
20
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26
4
4
65
1.29
99506626--99506704
19
4.1
19
77
11
63
32
2
2
62
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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2
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2.0
21
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2
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2.0
94
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17
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5
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22
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46
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21
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23
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49
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2
163
28
27
14
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99553192--99553340
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4.8
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0
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26
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50
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0
0
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0
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265
31
7
12
48
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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