Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  343  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109810811--109810858
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0
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0
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1.56
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0
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2.0
19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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2.4
144
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462
37
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14
30
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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3.1
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7.7
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20
26
21
1.98
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3.3
15
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0
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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0
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1.58
110000800--110000900
38
2.5
41
71
12
102
23
19
28
27
1.99
110000802--110000936
39
3.4
39
76
8
123
24
20
27
27
1.99
110001038--110001078
18
2.3
18
87
8
57
48
0
21
29
1.50
110001188--110001237
3
16.7
3
95
0
82
68
4
0
28
1.08
110001601--110001638
20
1.9
20
84
10
51
47
0
10
42
1.38
110003730--110003773
15
3.1
13
81
18
52
40
0
2
56
1.11
110003721--110003783
30
2.1
30
82
11
76
46
0
3
50
1.17
110009428--110009527
39
2.6
38
90
1
155
13
26
24
37
1.91
110010814--110010839
12
2.2
12
100
0
52
61
15
7
15
1.55
110010969--110011019
18
2.7
19
84
9
68
72
7
0
19
1.08
110010979--110011033
18
3.0
18
83
2
56
69
3
0
27
1.05
110010982--110011039
26
2.2
26
84
6
71
67
5
0
27
1.12
110012551--110012585
18
1.9
18
88
0
52
28
0
5
65
1.15
110014387--110014439
4
13.0
4
84
11
54
18
49
5
26
1.70
110015124--110015456
176
1.9
174
87
4
487
23
14
16
45
1.84
110017930--110017969
21
2.0
20
86
13
57
30
2
5
62
1.29
110017944--110018000
28
2.0
29
83
16
75
31
0
5
63
1.17
110018519--110018590
27
2.6
28
80
10
85
61
1
1
36
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110024055--110024355
47
6.5
47
92
0
428
18
23
14
42
1.88
110036746--110036783
15
2.5
15
86
0
58
52
31
5
10
1.58
110039828--110039931
54
1.9
54
84
3
138
40
20
12
26
1.88
110039931--110040115
99
1.9
101
90
2
302
42
24
10
22
1.85
110040183--110040373
97
2.0
97
83
4
242
45
23
7
24
1.78
110077130--110077158
13
2.1
14
93
6
51
37
6
0
55
1.27
110086252--110086926
300
2.3
295
84
5
875
28
12
20
38
1.88
110091456--110091505
14
3.6
14
77
0
55
42
2
4
52
1.31
110092024--110092084
30
2.0
30
81
9
70
59
6
34
0
1.24
110093524--110093658
39
3.4
39
76
8
123
23
20
27
28
1.99
110102873--110102903
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
110106194--110106233
20
2.0
21
85
5
55
57
5
2
35
1.34
110107255--110107284
16
1.9
16
93
6
53
50
0
16
33
1.46
110107699--110107796
51
1.9
51
100
0
196
51
22
6
20
1.69
110112571--110113241
238
2.8
238
83
6
833
38
23
12
25
1.90
110116710--110116744
5
7.0
5
93
0
61
80
2
0
17
0.84
110116711--110116758
20
2.4
20
86
6
62
79
6
2
12
1.01
110118390--110118438
22
2.2
23
85
3
64
20
12
20
46
1.82
110118419--110118465
24
2.0
23
84
12
60
19
6
14
59
1.56
110118551--110118583
16
2.1
16
88
11
50
45
0
3
51
1.16
110118921--110118962
23
1.9
21
90
9
66
26
19
0
54
1.44
110123425--110123485
29
2.1
29
81
9
70
26
14
6
52
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
110123836--110123874
20
2.0
20
84
0
51
71
2
2
23
1.10
110128332--110128372
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
110133634--110133755
9
12.8
9
66
19
52
66
4
0
28
1.15
110133632--110133703
19
3.9
19
72
13
53
62
4
0
33
1.14
110133642--110133714
19
3.9
19
74
15
71
63
4
0
32
1.14
110133635--110133759
17
6.6
18
70
20
78
65
4
0
29
1.16
110133849--110133879
16
1.9
16
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0
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4.5
19
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18
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59
4
1
34
1.26
110149749--110149811
19
3.3
19
72
12
56
61
4
3
30
1.32
110152087--110152122
10
3.9
10
89
10
51
16
8
0
75
1.04

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352