Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  273  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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155
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0
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1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.5
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13
26
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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27
5.6
27
82
6
164
40
21
9
28
1.84
89682362--89682555
81
2.4
80
77
9
187
36
21
10
30
1.88
89682432--89682581
81
1.9
81
85
5
214
40
21
9
28
1.84
89682432--89682665
54
4.3
54
75
7
170
40
20
8
30
1.83
89682548--89682645
27
3.6
27
78
10
99
40
17
8
33
1.79
89683603--89683736
42
3.2
42
97
0
250
32
14
19
33
1.92
89683760--89683905
31
4.7
31
94
0
258
28
16
26
28
1.97
89689559--89689669
27
4.2
26
87
5
150
36
22
25
15
1.93
89690050--89690079
8
3.8
8
90
0
51
3
23
23
50
1.64
89691063--89691136
24
3.1
24
90
0
121
24
43
1
31
1.63
89691167--89691240
37
2.0
37
100
0
148
37
18
5
37
1.74
89705952--89706171
40
5.6
40
84
7
272
26
26
22
24
2.00
89705952--89706168
79
2.7
80
85
6
266
26
27
22
23
2.00
89714670--89714710
21
2.0
21
90
9
66
46
0
24
29
1.53
89722782--89722844
28
2.3
28
97
2
119
36
0
6
57
1.24
89723285--89723345
20
3.1
19
86
6
86
67
3
0
29
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89729890--89729920
7
4.4
7
91
0
53
9
0
16
74
1.07
89729916--89729945
7
4.3
7
91
0
51
26
13
0
60
1.34
89729941--89729980
7
5.7
7
96
0
62
30
35
0
35
1.58
89729934--89729981
14
3.4
14
88
0
69
29
31
0
39
1.57
89729920--89729981
7
8.9
7
90
0
61
27
27
0
45
1.54
89735690--89735799
2
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2
79
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113
2
50
0
46
1.22
89738606--89738728
42
2.9
41
78
13
115
25
18
23
32
1.97
89738650--89738759
42
2.6
42
78
9
125
25
19
23
31
1.98
89739058--89739113
26
2.2
26
100
0
112
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21
35
1.71
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67
3.6
68
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3
263
35
18
23
23
1.96
89747707--89747768
29
2.1
29
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5
108
41
24
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30
1.70
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30
2.0
30
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0
77
31
22
8
37
1.84
89751842--89751884
22
2.0
22
95
4
79
23
9
6
60
1.51
89753523--89753653
57
2.3
58
80
4
149
31
21
16
31
1.95
89759691--89759957
40
6.7
40
95
0
480
29
20
28
21
1.98
89768354--89768620
40
6.7
40
95
0
471
29
20
27
21
1.98
89777149--89777257
57
1.9
58
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1
157
35
22
11
29
1.90
89780704--89780733
12
2.5
12
100
0
60
16
43
26
13
1.85
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22
2.0
22
82
8
54
9
25
0
65
1.21
89786787--89786828
18
2.3
19
84
12
52
9
23
0
66
1.21
89786801--89786852
23
2.2
24
83
10
72
5
25
0
69
1.10
89789079--89789122
22
2.0
22
100
0
88
13
9
13
63
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89789192--89789249
25
2.3
26
81
3
64
32
6
6
53
1.54
89792279--89792326
23
2.1
23
92
3
80
18
14
8
58
1.61
89797025--89797302
92
3.0
92
72
9
228
33
16
23
27
1.95
89801734--89801796
27
2.3
26
76
10
63
50
11
0
38
1.38
89801763--89801792
15
2.0
15
93
0
51
40
10
0
50
1.36
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2.0
33
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8
98
30
24
21
24
1.99
89803169--89803249
34
2.4
34
79
8
92
28
23
23
24
2.00
89812472--89812523
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2.6
20
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0
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1
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1.57
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10.2
26
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225
41
27
16
15
1.88
89814073--89814352
52
5.4
52
81
6
280
40
27
16
15
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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