Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  183  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60156700--60156880
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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120
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5
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0
0
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20
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3.0
30
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15
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5
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129
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3
398
25
17
20
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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23
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25
17
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60348071--60348249
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0
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150
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25
18
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2.0
25
84
3
66
20
28
20
32
1.97
60362651--60362967
55
5.9
54
77
3
314
37
17
23
21
1.94
60362662--60362954
109
2.7
109
94
0
498
36
18
23
21
1.95
60365231--60365428
42
4.6
42
84
7
222
28
25
14
30
1.95
60365356--60365479
47
2.7
46
86
2
167
29
27
16
27
1.97
60365504--60365650
31
4.7
31
88
0
204
26
27
19
25
1.99
60365690--60365852
50
3.2
50
89
10
256
26
21
14
37
1.92
60365628--60365852
105
2.3
98
84
9
289
27
20
16
36
1.94
60368436--60368494
23
2.6
22
78
19
68
23
22
18
35
1.96
60369300--60369350
22
2.3
22
96
0
93
29
11
17
41
1.85
60370365--60370515
43
3.5
43
84
0
194
23
16
29
30
1.96
60371291--60371331
21
2.0
21
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9
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2
0
21
0.92
60371441--60371607
82
2.0
83
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2
282
40
11
13
34
1.80
60372279--60372334
28
2.0
28
100
0
112
42
17
7
32
1.77
60374300--60374353
27
2.1
25
83
10
65
31
1
3
62
1.23
60384130--60384172
17
2.6
17
92
3
70
27
16
39
16
1.90
60384753--60384802
22
2.2
22
89
3
73
70
6
8
16
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60384766--60384818
22
2.4
22
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6
54
73
5
3
16
1.17
60385038--60385241
3
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3
68
16
104
59
0
7
31
1.32
60385096--60385241
29
5.0
28
70
17
93
60
0
8
30
1.32
60385133--60385241
41
2.7
39
83
8
112
61
0
6
31
1.27
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18
4.0
18
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0
81
30
18
13
37
1.89
60388973--60389046
36
2.1
36
84
0
94
31
16
13
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1.87
60406325--60406459
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2.7
50
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1
171
37
6
13
42
1.70
60406356--60406432
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4.4
19
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42
1.67
60410970--60410996
14
1.9
14
100
0
54
44
0
14
40
1.46
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35
2.9
35
71
19
85
28
18
19
32
1.96
60416920--60416988
34
2.0
34
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0
129
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14
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1.70
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26
2.1
26
100
0
108
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7
27
31
1.84
60434375--60434438
18
3.5
18
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10
58
3
32
3
60
1.28
60434477--60434506
5
5.8
5
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7
51
36
0
0
63
0.95
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40
2.8
40
86
2
145
27
21
24
26
1.99
60440002--60440142
40
3.5
40
93
1
230
23
19
28
28
1.98
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40
1.9
40
94
5
136
27
21
25
26
1.99
60448340--60448480
40
3.5
40
92
1
221
23
19
29
28
1.98
60458052--60458155
8
12.0
8
73
14
66
71
0
1
25
1.03
60458054--60458154
18
5.7
18
75
10
91
72
0
1
24
1.02
60458054--60458154
9
11.3
9
72
16
68
72
0
1
24
1.02
60458877--60458937
28
2.2
28
82
5
70
67
9
4
18
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60462015--60462080
21
3.2
20
71
25
57
62
1
6
30
1.29
60465770--60465806
18
2.1
18
94
0
65
18
5
5
70
1.27
60473861--60473887
13
2.1
13
100
0
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0
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1.40
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6
5.7
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0
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0
20
0
0.73
60477026--60477077
18
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18
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2
61
73
0
26
0
0.84
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12
3.1
12
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0
65
78
0
21
0
0.75
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2.1
27
83
12
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42
0
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1.34
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0
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0
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995
59
6
6
27
1.46
60486271--60486307
18
2.1
18
94
0
65
18
5
5
70
1.27

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352