Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  172  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56269617--56269732
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1.85
56271229--56271336
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89
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21
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1.85
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30
0
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1.98
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25
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30
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185
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1.99
56319975--56320147
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21
29
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1.98
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30
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17
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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T
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27
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20
2.3
20
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2
29
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39
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24
15
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1
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1.20
56424215--56424334
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3.3
36
90
5
179
24
33
10
32
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56424325--56425512
2
614.0
2
70
10
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2
57
1
38
1.21
56425557--56425614
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3.2
19
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1.00
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0
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0
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26
2.0
24
88
7
73
30
0
6
64
1.18
56426847--56426938
9
9.9
9
71
10
51
36
4
2
56
1.31
56426891--56426940
20
2.6
19
79
17
50
36
4
4
56
1.37
56426887--56426953
30
2.2
30
84
7
82
34
5
2
56
1.39
56426945--56427027
28
3.0
29
77
18
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31
1
1
66
1.07
56429867--56429915
25
2.0
24
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4
62
48
2
2
46
1.25
56431708--56431748
21
2.0
21
86
13
59
46
2
2
48
1.28
56435517--56435579
22
2.8
22
74
11
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15
15
9
58
1.62
56441209--56441261
26
2.0
26
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7
81
11
16
0
71
1.13
56442573--56442613
22
1.9
21
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26
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1.70
56457008--56457056
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10
0
32
1.32
56457853--56457894
22
1.9
22
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0
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64
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1.46
56458655--56458690
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18
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0
0
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0.96
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18
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17
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10
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0
2
31
1.04
56459907--56459962
18
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18
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32
0
5
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1.18
56467757--56467849
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11
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26
5
32
1.79
56467831--56467885
16
3.4
16
80
5
67
30
21
7
40
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
20
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0
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7
35
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26
2.0
26
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4
2
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1.30
56469187--56469258
21
3.3
20
73
16
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41
5
1
51
1.34
56477883--56477947
20
3.2
20
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0
76
16
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26
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1.96
56477893--56477957
20
3.2
20
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30
1.99
56477884--56477982
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22
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1.95
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2.0
28
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51
0
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1.13
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1
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17
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56495396--56495461
24
2.7
23
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77
1
6
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1.04
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3.1
15
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1.28
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47
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24
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12
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2.6
45
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19
26
22
1.98
56509149--56509310
46
3.5
45
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11
125
30
19
27
23
1.98
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51
75
15
144
26
17
29
25
1.97
56513037--56513221
79
2.3
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82
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218
24
22
27
25
2.00
56513037--56513221
40
4.7
40
82
6
216
24
22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
56518498--56518791
46
6.4
45
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9
226
26
18
28
26
1.98
56518541--56518759
94
2.4
92
83
8
266
26
17
28
27
1.97
56518541--56518791
44
5.5
44
80
9
247
26
17
29
27
1.97
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90
4
261
27
30
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28
1.94
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2.2
45
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22
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10
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55
4.8
53
75
10
209
35
16
25
22
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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