Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  113  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36243845--36243933
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20
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6.6
27
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28
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36264559--36264736
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28
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1.9
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28
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1.97
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6.6
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28
28
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26
1.97
36272617--36272794
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3.3
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10
204
28
28
16
26
1.97
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1.9
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215
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28
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6.6
27
79
3
115
28
28
16
26
1.97
36280685--36280862
54
3.3
55
80
10
204
28
28
16
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1.9
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215
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28
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60
1.34
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2.0
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2.0
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2
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67
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35
2.2
35
84
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97
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2
1
68
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
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46
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2
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1.35
36298380--36298556
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23
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4
62
1.35
36302203--36302247
19
2.4
19
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28
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100
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2.6
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2
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2.0
81
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232
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21
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21
19
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132
2.2
131
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20
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1.97
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20
19
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4
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20
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29
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2
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2.8
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34
23
9
31
1.88
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2.5
20
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0
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14
4
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.85
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2.1
24
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0
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1.21
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21
2.0
20
90
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27
10
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62
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2.0
22
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1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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15
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15
75
25
59
45
0
28
26
1.54
36410985--36411112
21
6.2
21
81
1
125
44
15
22
17
1.86
36410993--36411113
42
2.9
42
86
0
161
45
14
22
17
1.85
36412739--36412910
93
1.8
93
93
2
301
29
29
20
20
1.98
36412732--36412907
46
3.8
46
77
14
200
30
29
19
20
1.97
36414334--36414383
21
2.5
20
80
6
55
38
12
4
46
1.60
36428876--36428900
11
2.3
11
100
0
50
24
32
24
20
1.98
36430486--36430593
42
2.6
42
87
0
153
45
13
21
19
1.85
36430486--36430584
21
4.7
21
76
0
99
42
14
22
21
1.88
36430476--36430592
21
5.6
21
78
0
90
46
14
20
18
1.84
36431040--36431091
21
2.6
20
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6
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32
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51
1.56
36433184--36433254
32
2.2
32
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5
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16
7
28
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1.73
36434591--36434656
30
2.2
31
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22
1
40
34
1.63
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20
3.6
20
68
7
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9
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18
36
1.83
36448084--36448112
8
3.6
8
100
0
58
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24
0
37
1.56
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27
7.2
27
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0
253
30
20
6
42
1.77
36450486--36450679
81
2.4
81
90
0
289
30
20
6
42
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36450486--36450707
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2.7
79
83
6
212
28
19
9
42
1.81
36451009--36451068
27
2.3
26
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2
75
21
23
20
35
1.96
36451187--36451305
6
19.3
6
67
17
66
20
18
12
48
1.80
36451218--36451284
25
2.7
25
92
0
107
20
22
10
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1.81
36451187--36451284
31
3.4
30
75
16
98
20
19
12
47
1.81
36455396--36455610
40
5.5
40
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6
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23
27
23
25
2.00
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40
5.5
40
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5
273
23
27
24
25
2.00
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47
7.6
47
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2
572
29
29
8
32
1.87
36483139--36483320
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4.6
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0
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26
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25
2.00
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3.0
96
96
0
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25
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25
2.00
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2.3
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0
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2.00
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2.3
40
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0
125
28
24
20
26
1.99
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38
2.0
38
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5
107
24
26
18
30
1.98
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47
7.6
47
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2
581
29
29
8
32
1.87
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40
2.2
40
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0
111
33
16
20
29
1.94
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14
15.9
14
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1
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43
2.0
43
100
0
174
27
2
22
47
1.64
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7
25.4
7
71
7
69
23
1
29
45
1.63
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36
2.6
35
74
6
87
22
0
35
41
1.54
36492267--36492472
7
28.9
7
70
9
67
23
1
32
42
1.63
36493097--36493150
18
3.0
18
91
0
90
11
33
0
55
1.35
36497505--36497615
27
4.2
26
82
5
123
17
25
22
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36498091--36498121
15
2.1
15
100
0
62
35
6
19
38
1.77
36498953--36498983
15
2.0
16
93
6
55
51
3
6
38
1.44
36499246--36499277
16
2.0
16
93
0
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59
12
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25
1.48
36506598--36506769
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3.7
46
77
13
181
31
29
17
20
1.96
36506605--36506776
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1.8
93
91
0
281
30
29
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1.97
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3.9
27
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16
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23
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36510258--36510288
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2.0
16
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3
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1.44
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8
238
23
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1.96
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21
2.0
20
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5
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45
20
0
35
1.51
36525139--36525229
19
4.9
19
88
8
143
36
15
10
37
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352