Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  12  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3712837--3713083
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2
1621
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0
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23
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24
40
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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12
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16
16
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0
0
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3
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2
4
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1.26
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2.9
21
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13
81
29
6
0
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4
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0
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21
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48
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2.0
95
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21
20
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1.9
18
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0
52
0
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5
60
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2.0
20
85
4
55
42
0
7
50
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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0
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0
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50
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17
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62
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30
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1.08
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61
67
2
0
30
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3901756--3901793
20
1.9
20
88
0
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39
5
0
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2.1
25
92
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88
25
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38
1.86
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0
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4
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0
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10
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0
2
52
1.13
3917022--3917063
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
3917175--3917209
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
3917009--3917322
157
2.0
157
96
0
574
47
4
3
44
1.40
3917445--3917512
16
4.2
16
88
0
100
35
33
0
30
1.58
3921227--3921262
18
2.0
18
100
0
72
61
11
11
16
1.57
3921494--3921576
27
3.0
26
75
16
94
26
2
8
62
1.36
3921479--3921594
57
2.0
57
83
9
148
27
1
10
60
1.39
3925029--3925067
2
19.5
2
83
0
51
43
0
0
56
0.99
3925032--3925072
16
2.5
16
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4
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41
0
0
58
0.98
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24
2.2
24
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40
1
0
57
1.10
3925790--3925895
31
3.6
28
78
12
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49
11
8
31
1.69
3925848--3925906
31
1.9
31
85
0
82
47
10
10
32
1.71
3930380--3930423
21
2.1
21
100
0
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22
13
13
50
1.77
3930919--3930998
20
4.2
20
65
20
55
48
6
10
35
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3935881--3935918
18
2.1
18
100
0
76
26
10
28
34
1.90
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12
2.2
12
100
0
54
29
14
0
55
1.40
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11
2.5
11
100
0
56
53
17
7
21
1.67
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21
2.0
21
90
0
66
30
11
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7
1.66
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21
2.0
21
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0
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4
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0
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0
0
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0.90
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2.7
27
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10
4
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11
13
0
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50
2.0
51
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5
161
24
18
12
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1.85
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16
1.9
16
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0
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0
3
54
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12
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0
53
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0
25
0
0.82
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23
12
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17
1.83
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6.7
45
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3
384
38
15
24
20
1.92
3974311--3974374
22
2.9
23
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13
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62
3
0
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1.11
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16
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56
6
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1.25
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115
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115
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1371
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15
0
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16
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0
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19
0
0.90
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5
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0
38
0
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0.96
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19
2.2
19
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4
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0
40
0
60
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0
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66
0
0
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3
9.0
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100
0
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0
0
66
0.92
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33
2.3
33
84
4
111
57
5
3
33
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3994184--3994226
22
2.0
22
90
0
68
20
11
9
58
1.61
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2.0
32
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14
80
43
0
9
46
1.35
4027157--4027228
3
24.3
3
75
8
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61
4
2
31
1.29
4027241--4027330
29
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28
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1.50
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0
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0
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0
2
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2.0
68
91
4
216
42
8
20
29
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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