Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  19  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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0
0
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53
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1
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1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1
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1.9
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1
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1.00
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2.0
20
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14
57
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6242299--6242363
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28
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62
63
2
0
34
1.06
6255155--6255214
29
2.1
28
84
12
77
63
1
0
35
1.05
6255264--6255389
9
13.2
9
67
16
67
76
3
4
15
1.09
6255258--6255306
14
3.5
13
81
15
53
77
2
2
18
0.96
6255264--6255306
15
2.9
15
83
16
54
79
2
2
16
0.95
6255256--6255318
29
2.2
28
78
16
67
73
3
1
22
1.07
6255345--6255388
19
2.3
19
88
0
61
77
2
4
15
1.04
6255658--6255704
22
2.1
22
88
7
69
59
2
0
38
1.09
6255658--6255712
22
2.5
22
85
8
60
58
3
0
38
1.16
6255693--6255743
24
2.1
25
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10
79
54
3
0
41
1.19
6255761--6255790
14
2.1
15
93
6
53
76
0
0
23
0.78
6255799--6255833
8
4.5
8
96
3
63
68
8
11
11
1.39
6259378--6259484
53
2.0
53
96
0
196
23
15
26
34
1.95
6261958--6261990
15
2.2
15
89
10
50
72
0
27
0
0.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6265286--6265316
14
2.2
14
94
0
53
51
0
0
48
1.00
6265947--6265989
17
2.5
18
78
21
56
30
0
0
69
0.88
6265944--6265986
15
2.7
15
85
10
50
30
0
0
69
0.88
6265941--6265988
13
3.4
14
78
18
55
31
0
0
68
0.90
6265936--6265989
27
2.0
27
82
7
65
33
0
0
66
0.92
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22
1.9
22
100
0
84
35
9
11
42
1.74
6270681--6270812
65
2.0
65
98
0
255
27
24
14
34
1.94
6277510--6277566
20
2.8
20
84
10
64
31
0
3
64
1.10
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24
2.0
24
95
0
87
43
0
20
35
1.52
6286435--6286485
18
2.7
19
81
6
59
56
0
0
43
0.99
6286435--6286479
6
7.2
6
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2
54
53
0
0
46
1.00
6294555--6294599
19
2.4
19
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3
56
6
8
20
64
1.44
6306272--6306336
28
2.2
30
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10
73
41
1
1
55
1.18
6315587--6315617
4
7.8
4
100
0
62
0
25
0
74
0.82
6317707--6317850
72
2.0
73
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1
272
38
11
9
41
1.72
6319438--6319469
6
5.3
6
96
0
55
37
28
15
18
1.92
6319879--6319924
23
2.0
24
83
8
60
63
0
2
34
1.07
6330168--6330304
70
2.0
70
91
2
222
40
23
15
20
1.90
6330812--6330838
3
9.0
3
100
0
54
66
0
33
0
0.92
6333506--6333531
10
2.6
10
100
0
52
34
7
0
57
1.27
6338645--6338862
121
1.8
121
85
6
307
38
18
16
26
1.92
6341040--6341245
47
4.3
47
80
8
184
29
28
16
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6343755--6343835
15
5.5
15
83
1
101
60
13
16
9
1.58
6343755--6343839
45
1.9
44
85
2
116
58
16
15
9
1.61
6343767--6343844
15
5.2
15
77
9
70
57
15
15
11
1.65
6347031--6347237
47
4.3
47
80
6
184
29
28
16
25
1.97
6348650--6348716
18
3.8
17
74
16
57
62
10
2
23
1.41
6348810--6348842
14
2.4
14
90
10
50
72
9
9
9
1.28
6359739--6359781
7
6.3
7
91
2
52
9
4
86
0
0.71
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2.0
37
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0
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9
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3.0
14
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6
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69
0
27
2
1.00
6369874--6369921
15
3.3
14
80
8
51
66
0
31
2
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352