Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  259  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85390250--85390316
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2.4
29
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137
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1.84
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14
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1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.11
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26
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2.2
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2.0
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2.1
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5
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23
26
24
2.00
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2.00
85474203--85474333
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2.1
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2.2
36
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0
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28
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2.3
19
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2.2
37
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2
132
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15
7
30
1.73
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4.8
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211
29
17
28
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2.3
40
92
0
146
50
7
14
27
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
0
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4.5
120
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0
1011
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2
4
48
1.37
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18
2.0
17
94
5
61
42
0
0
57
0.99
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4.2
16
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3
111
37
36
1
24
1.65
85525192--85525260
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2.1
32
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2
111
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36
1
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1.65
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25
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0
1
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2
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19
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2
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9
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2
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9
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2
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100
0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
85569647--85569673
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1.56
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1
1
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0.76
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2.0
24
100
0
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8
20
38
1.82
85583297--85583335
6
6.5
6
93
0
69
17
30
0
51
1.46
85588474--85588524
22
2.3
23
96
3
95
45
0
13
41
1.44
85590622--85590729
40
2.7
40
81
1
128
42
28
16
12
1.84
85592337--85592382
17
2.9
16
83
6
58
67
4
0
28
1.10
85594759--85595018
39
7.0
39
77
9
265
33
31
18
16
1.93
85594879--85594935
28
2.0
28
89
0
87
33
26
22
17
1.96
85594848--85594974
67
1.9
67
88
3
193
34
29
18
16
1.93
85594801--85595015
106
2.0
106
87
1
306
33
29
18
18
1.94
85597117--85597237
61
2.0
61
82
6
147
50
8
2
38
1.46
85599917--85599988
20
3.6
21
76
12
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50
0
1
48
1.09
85599972--85600013
13
2.9
14
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13
50
54
0
0
45
0.99
85599976--85600012
16
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59
0
0
40
0.97
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16
75
15
53
42
0
0
57
0.98
85601648--85601690
22
2.0
22
85
0
59
62
11
6
18
1.50
85602981--85603092
27
4.2
26
78
12
109
37
21
24
16
1.94
85604520--85604584
24
2.7
24
90
0
112
27
38
0
33
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85604485--85604584
48
2.1
47
83
7
121
23
37
4
36
1.73
85610834--85610926
27
3.4
27
82
8
82
40
21
23
13
1.89
85610852--85610924
27
2.7
27
87
6
94
38
24
26
10
1.88
85612358--85612432
24
3.1
24
92
0
123
25
40
1
33
1.64
85627745--85627789
19
2.4
19
85
7
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33
2
0
64
1.06
85628150--85628198
19
2.5
19
84
12
64
73
6
2
18
1.14
85628179--85628208
14
2.1
14
93
0
51
73
3
6
16
1.18
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2.4
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15
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4
0
68
1.08
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26
2.2
26
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6
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28
0
10
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1.29
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52
2.0
53
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1
176
39
10
9
40
1.72
85635559--85635733
70
2.5
70
94
1
307
40
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13
32
1.83
85640350--85640410
26
2.3
27
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2
106
44
6
21
27
1.77
85640979--85641151
87
2.0
87
90
0
274
39
13
8
38
1.74
85641230--85641364
69
2.0
69
88
2
200
51
6
4
37
1.49
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69
2.1
69
83
2
175
53
5
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37
1.41
85648231--85648264
10
3.4
10
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0
50
50
26
0
23
1.50
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20
2.5
19
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13
69
47
28
0
23
1.52
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13
2.4
14
90
5
50
66
3
0
30
1.06
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34
2.0
34
100
0
138
43
11
2
42
1.56
85685650--85685693
23
1.9
23
81
9
54
38
27
0
34
1.57
85702358--85702412
28
1.9
29
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3
85
18
45
20
16
1.86
85703616--85703983
48
7.7
48
82
1
398
24
29
19
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85703616--85703983
144
2.6
144
87
3
501
24
29
19
26
1.99
85705633--85705883
87
2.9
86
92
1
421
24
17
32
24
1.97
85705619--85705883
130
2.0
131
91
2
435
24
17
33
25
1.96
85705633--85705883
43
5.8
43
93
0
421
24
17
32
24
1.97
85705958--85706040
31
2.6
31
80
3
85
61
19
3
15
1.48
85711936--85712125
9
20.6
9
72
11
107
37
1
13
47
1.52
85711936--85712098
71
2.3
69
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4
202
38
1
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259
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2
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1.53
85711912--85712125
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1.9
114
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299
38
1
13
46
1.51
85711972--85712156
87
2.1
87
84
7
234
38
2
11
47
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352