Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  306  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100147094--100147792
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2.0
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1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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136
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26
37
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100293841--100293891
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1.88
100308534--100308564
4
8.0
4
92
7
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74
0
25
0
0.82
100308534--100308572
19
2.1
19
85
9
53
74
0
23
2
0.94
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1.9
80
88
3
231
27
23
19
29
1.98
100320357--100320401
23
2.0
23
100
0
90
26
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28
35
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100336829--100336866
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21
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0
7
12
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28
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42
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30
25
16
28
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4.9
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0
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33
20
25
21
1.97
100382144--100382177
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2.1
17
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52
32
0
14
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100382959--100383046
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12
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2
0
25
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0
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0
28
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100382976--100383065
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7
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100382977--100383065
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4.1
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0
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24
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1.24
100386985--100387075
43
2.1
43
87
0
128
27
15
26
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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0
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16
29
1.96
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2.1
16
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8
2
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2
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28
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1.98
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28
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1.8
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29
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1.98
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0
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66
0
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12
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0
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0
50
0
1.00
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25
17
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1.98
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132
2.6
132
96
0
627
29
25
16
28
1.97
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2.0
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29
22
19
29
1.98
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134
2.7
134
94
0
626
29
22
19
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100426365--100426558
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4.3
46
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31
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19
25
1.98
100426062--100426489
229
1.9
229
92
1
723
29
22
19
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1.98
100426396--100426957
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12.4
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131
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23
19
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1.98
100426394--100426857
231
2.0
229
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0
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22
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1.98
100426528--100426723
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2.0
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95
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22
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4.3
46
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19
25
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26
2.00
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5.2
42
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114
24
23
24
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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