Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  11  of  352  ( 42160 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3365316--3365560
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2.0
33
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8
82
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5
2
41
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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19
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15
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74
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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67
1.04
3629591--3629625
17
2.1
17
88
0
52
34
22
0
42
1.54
3631514--3631558
23
2.0
23
90
0
72
33
0
8
57
1.30
3651955--3652013
30
1.9
31
89
3
93
40
5
1
52
1.33
3656809--3656870
30
2.0
32
84
12
85
69
4
1
24
1.17
3657164--3657268
41
2.6
41
76
13
99
60
2
1
35
1.23
3659239--3659317
39
2.0
39
100
0
158
35
15
20
29
1.93
3664067--3664146
31
2.6
30
84
5
90
35
1
10
53
1.42
3664333--3664398
31
2.2
30
86
5
98
50
3
0
46
1.16
3676177--3676262
45
1.9
46
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124
54
3
17
24
1.58
3683268--3683338
36
2.0
36
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0
133
12
18
18
50
1.77
3688657--3688717
29
2.0
32
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15
85
37
9
11
40
1.75
3690657--3690699
10
4.3
10
79
8
52
62
0
2
34
1.08
3690649--3690708
28
2.1
28
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11
70
63
1
3
31
1.20
3691647--3691699
15
3.5
15
75
14
54
69
0
28
1
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
26
87
3
78
66
0
32
1
1.03
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21
1.9
20
89
5
60
66
0
33
0
0.92
3691644--3691705
31
2.0
30
84
3
79
67
0
30
1
1.00
3691798--3691855
26
2.2
26
84
0
71
43
8
6
41
1.62
3695738--3695776
17
2.3
17
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8
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33
10
10
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1.72
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8
4.5
8
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3
54
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5
0
29
1.17
3697336--3697391
24
2.3
24
77
17
62
66
3
1
28
1.19
3697340--3697387
16
3.1
15
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6
60
64
4
2
29
1.23
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28
2.2
27
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3
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56
3
5
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1.37
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25
9.0
25
71
14
122
55
4
5
34
1.43
3698243--3698387
30
4.8
30
91
0
236
21
4
48
25
1.67
3699145--3699187
14
2.9
15
79
10
52
67
4
13
13
1.38
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76
5.8
75
71
14
340
33
21
16
29
1.95
3699395--3699422
14
2.0
14
100
0
56
57
7
21
14
1.61
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90
2.1
88
82
8
230
36
19
17
26
1.94
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166
3.9
165
76
15
460
33
21
17
28
1.95
3699156--3699867
239
3.0
239
91
3
1150
34
20
16
27
1.95
3699637--3699665
14
2.1
14
100
0
58
65
6
13
13
1.45
3699553--3699721
93
1.8
92
88
6
261
34
19
17
28
1.94
3699645--3699956
75
4.2
74
81
7
366
33
21
17
27
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3708125--3708160
12
3.0
12
95
0
63
41
5
25
27
1.77
3709687--3709734
16
3.1
15
90
6
69
64
2
2
31
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3709683--3709738
24
2.3
24
81
6
69
66
1
1
30
1.12
3709683--3709734
8
6.5
8
82
8
61
65
1
1
30
1.14
3709883--3709931
25
2.0
25
91
0
80
51
6
8
34
1.57
3709933--3709997
25
2.6
25
82
7
87
56
4
6
32
1.44
3709963--3710023
22
2.7
22
77
7
61
55
1
4
37
1.31
3709877--3710091
47
4.5
48
74
13
160
55
3
6
34
1.42
3710579--3710755
30
5.8
30
94
1
282
24
3
48
24
1.67
3710579--3710755
61
2.9
60
91
3
282
24
3
48
24
1.67
3712539--3713497
151
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145
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14
637
29
7
5
56
1.51
3712638--3712956
155
2.1
153
83
8
395
29
6
6
57
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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