Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  52  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16874576--16874704
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2.3
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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27
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2.2
12
100
0
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1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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17
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2.0
264
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16
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16982006--16982036
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15
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29
7
0
63
1.21
17007898--17007927
15
1.9
16
93
6
53
70
0
0
30
0.88
17010753--17010792
21
1.9
21
100
0
80
35
20
20
25
1.96
17011106--17011154
24
2.0
24
100
0
98
24
26
12
36
1.91
17014684--17014728
20
2.2
20
88
0
63
46
4
11
37
1.60
17019298--17019411
51
2.2
51
95
0
201
28
23
14
33
1.94
17019399--17019425
7
3.9
7
100
0
54
0
29
25
44
1.54
17023010--17023036
14
1.9
14
100
0
54
51
7
18
22
1.70
17028228--17028452
49
5.0
42
77
15
204
30
26
13
29
1.94
17028298--17028530
49
4.8
49
87
4
271
31
26
13
28
1.94
17028263--17028483
91
2.4
92
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8
270
30
26
13
28
1.94
17028313--17028530
95
2.3
96
82
5
255
30
27
14
27
1.95
17028552--17028666
31
3.7
31
92
0
185
25
27
20
26
1.99
17028883--17028917
17
2.1
17
100
0
70
54
11
0
34
1.37
17033510--17033765
49
5.6
46
87
6
264
29
26
14
29
1.95
17033580--17033810
49
4.8
48
86
7
260
30
26
13
28
1.94
17033545--17033810
91
2.9
88
79
14
284
30
26
14
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17033554--17033810
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5.6
46
82
11
153
29
26
14
28
1.95
17033545--17033810
140
1.9
138
80
11
310
30
26
14
28
1.95
17033832--17033917
31
2.8
31
85
1
120
25
26
20
26
1.99
17033899--17034021
50
2.4
51
91
2
203
26
21
16
36
1.94
17038599--17038949
189
1.9
183
83
5
454
29
16
16
37
1.91
17039267--17039316
26
1.9
26
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8
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38
2
0
60
1.09
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17
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41
0
2
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1.15
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2.3
20
83
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53
0
2
44
1.12
17064963--17064991
14
2.0
15
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6
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24
13
6
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1.63
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4.5
8
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7
63
88
0
11
0
0.51
17074399--17074432
15
2.3
15
100
0
68
88
0
11
0
0.52
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20
2.5
20
82
3
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31
6
6
56
1.49
17081169--17081195
13
2.1
13
100
0
54
29
14
7
48
1.71
17082365--17082426
32
1.9
32
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0
115
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16
30
1.90
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18
2.1
19
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0
29
1.24
17082737--17082778
23
1.9
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9
0
28
1.27
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1.9
40
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10
111
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28
13
18
1.88
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40
2.4
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14
106
40
34
8
16
1.79
17093632--17093700
24
2.8
24
84
2
84
34
20
24
20
1.96
17093654--17093711
24
2.4
24
91
0
89
34
24
24
17
1.96
17093672--17093737
24
2.7
24
80
2
69
37
19
22
19
1.94
17094655--17094680
13
2.0
13
100
0
52
23
23
15
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17096015--17096310
26
11.8
25
75
9
230
61
3
4
30
1.31
17096019--17096330
52
6.2
51
78
7
307
60
3
4
30
1.34
17096019--17096332
77
4.1
77
75
8
218
60
3
4
30
1.35
17096187--17096470
50
5.8
48
78
9
195
61
3
5
29
1.35
17101018--17101050
12
2.8
12
90
0
57
21
3
42
33
1.68
17106817--17106990
47
3.7
47
79
13
207
29
27
20
22
1.98
17106822--17106992
94
1.8
93
91
3
281
29
28
20
22
1.98
17107412--17107471
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2.0
30
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28
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1.86
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2.0
16
100
0
64
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6
0
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1.25
17110922--17111029
34
3.1
34
76
12
96
41
12
12
33
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352