Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11767983--11768069
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2.3
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22
28
1.92
11795806--11795920
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3.5
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57
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2.0
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2
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28
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0
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0
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3.5
40
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36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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79
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2.0
31
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200
1.9
200
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0
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2.8
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1.82
11880402--11880479
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28
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1.99
11888346--11888483
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2.7
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172
26
26
18
27
1.98
11894973--11895007
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5
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2.1
15
93
0
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35
6
32
25
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11914931--11914970
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11915711--11915740
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15
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0
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6
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1.75
11919289--11919328
18
2.4
17
87
8
55
40
5
12
42
1.64
11928629--11929003
41
9.1
41
91
0
590
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18
25
22
1.97
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2.2
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33
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11957368--11957433
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0
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38
6
12
1.69
11967217--11967324
52
2.0
54
94
3
193
32
9
3
54
1.50
11976104--11976134
6
5.2
6
100
0
62
16
0
51
32
1.44
11976668--11976699
7
4.9
7
88
11
50
56
0
0
43
0.99
11986806--11986852
21
2.4
19
79
10
51
44
0
2
53
1.12
11987574--11987625
22
2.4
21
81
12
52
17
3
5
73
1.19
11987699--11987766
21
3.1
21
87
10
93
44
1
0
54
1.09
11987657--11987752
21
4.9
20
73
19
96
41
2
1
55
1.18
11987919--11987976
30
2.0
30
83
10
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10
10
5
74
1.22
11987973--11988015
20
2.2
20
87
8
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16
0
4
79
0.90
11987986--11988020
14
2.4
15
95
4
63
20
0
0
80
0.72
11988342--11988788
212
2.1
206
92
3
743
42
7
10
39
1.67
11990191--11990362
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1.8
93
93
0
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27
29
22
21
1.99
11990186--11990359
46
3.8
46
79
10
201
28
28
21
21
1.99
11992746--11992793
15
3.2
15
74
11
53
58
12
14
14
1.64
11993088--11993133
10
4.5
10
75
24
51
63
0
0
36
0.95
11993166--11993233
21
3.1
21
85
10
84
55
0
1
42
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11993180--11993241
21
3.0
20
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11
81
58
1
1
38
1.18
11993237--11993279
17
2.6
16
82
10
50
58
0
2
39
1.11
11993304--11993334
4
7.5
4
92
7
53
77
0
0
22
0.77
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20
2.0
22
90
9
70
52
0
7
40
1.29
11993882--11993928
20
2.1
23
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18
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51
0
6
42
1.27
11993872--11993921
25
2.0
25
84
0
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54
0
6
40
1.25
11994263--11994311
21
2.4
21
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3
64
57
4
0
38
1.18
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23
2.2
24
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60
1
0
37
1.08
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14
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13
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77
0
2
19
0.88
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18
1.9
19
94
5
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77
0
2
19
0.88
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21
2.9
19
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23
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76
3
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14
1.09
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2.0
26
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0
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17
19
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1.94
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26
2.0
26
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0
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5
5
43
1.52
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24
2.0
24
87
0
69
60
8
2
29
1.37
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2.1
16
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0
50
52
5
2
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1.41
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22
2.2
22
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14
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43
2
2
52
1.24
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11
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57
26
0
0
73
0.84
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1.9
23
90
4
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62
13
0
24
1.31
12028681--12028758
38
2.1
38
100
0
156
48
15
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30
1.66
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14
2.0
15
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51
65
0
0
34
0.93
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34
2.0
35
88
8
106
56
0
1
42
1.08
12039538--12039570
5
6.6
5
100
0
66
42
36
21
0
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12048647--12048678
6
5.3
6
100
0
64
34
50
15
0
1.45
12057784--12057833
25
2.0
25
88
7
75
52
8
12
28
1.66
12058977--12059092
38
3.0
38
83
8
128
30
18
22
29
1.97
12059597--12059666
22
3.3
21
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11
63
50
17
0
32
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2.7
35
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22
1
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41
1.61
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3.6
15
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1
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42
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84
89
0
270
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9
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0
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47
22
0
30
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15
2.3
15
89
5
50
63
0
9
27
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352