Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  352  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112897127--112897185
12
5.3
12
82
12
65
40
0
3
55
1.16
112898281--112898337
15
3.9
15
88
2
89
35
0
12
52
1.39
112898710--112898795
21
3.9
23
72
15
74
16
20
24
38
1.93
112899247--112899302
28
2.0
29
82
3
69
53
1
1
42
1.21
112900615--112900657
18
2.4
18
92
0
68
37
0
9
53
1.33
112900615--112900657
6
7.2
6
86
0
59
37
0
9
53
1.33
112900810--112900869
27
2.4
27
83
10
74
40
0
30
30
1.57
112901013--112901108
39
2.5
39
80
6
108
20
23
28
27
1.99
112905016--112905061
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
112905023--112905067
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
112908090--112908114
7
3.6
7
100
0
50
16
28
28
28
1.97
112913907--112913933
12
2.2
12
100
0
54
51
14
7
25
1.68
112913974--112914042
25
2.8
25
80
12
81
53
1
2
42
1.24
112921230--112921274
20
2.3
19
82
14
56
42
24
4
28
1.74
112922110--112922159
17
2.9
17
82
11
57
60
0
0
40
0.97
112950440--112950479
3
13.3
3
100
0
80
35
0
32
32
1.58
112953079--112953113
13
2.7
13
90
0
61
40
0
8
51
1.33
112962899--112962929
3
10.3
3
100
0
62
0
32
0
67
0.91
112986381--112986426
22
2.1
22
100
0
92
39
4
4
52
1.41
113000052--113000091
20
2.2
19
86
13
57
35
22
0
42
1.54
113001490--113001521
6
5.3
6
96
0
55
3
15
15
65
1.39
113001954--113001988
6
5.8
6
93
0
61
0
62
20
17
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113002076--113002112
14
2.6
14
86
0
56
2
27
0
70
1.01
113003342--113003372
9
3.4
9
95
0
53
6
35
58
0
1.24
113004360--113004391
15
2.1
15
100
0
64
6
6
25
62
1.42
113005524--113005637
56
2.0
56
100
0
228
42
5
8
43
1.58
113010300--113010400
49
2.1
49
96
3
186
33
17
17
30
1.94
113011229--113011260
12
2.6
13
85
14
50
46
0
0
53
1.00
113011233--113011267
18
1.9
18
88
0
52
42
0
2
54
1.15
113023832--113023868
19
1.9
19
88
0
56
56
5
2
35
1.36
113030412--113030452
20
2.0
20
95
0
73
41
4
7
46
1.53
113031701--113031766
31
2.1
31
82
0
78
36
4
10
48
1.58
113048985--113049018
17
2.0
17
94
0
59
23
32
5
38
1.79
113057915--113058055
75
1.9
75
88
2
214
44
12
10
32
1.76
113085152--113085304
78
2.0
78
89
0
234
25
20
24
29
1.99
113088871--113088938
30
2.3
30
100
0
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35
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1.73
113089397--113089492
47
2.0
47
88
4
140
34
9
25
31
1.87
113095178--113095214
16
2.3
16
100
0
74
37
29
5
27
1.79
113094929--113095457
259
2.0
263
95
2
960
32
17
14
34
1.91
113098722--113098764
12
3.1
14
80
19
54
65
0
0
34
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352

The End!