Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  61  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19210181--19210222
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2.0
21
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0
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1.37
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0
0
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0
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1.80
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0
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40
22
24
12
1.88
19230673--19230727
25
2.2
25
80
6
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1
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19235133--19235194
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2.2
28
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9
4.2
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0
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12
16
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19236170--19236207
18
2.1
18
100
0
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2
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100
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18
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1.9
88
88
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19
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4.4
70
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2.1
431
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0
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16
27
1.95
19244289--19244636
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4.8
73
75
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255
33
22
16
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19245164--19245330
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2.0
85
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2
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1.44
19257542--19257587
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2.0
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13
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40
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2
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0
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3.1
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29
24
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45
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19291553--19291620
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2.4
28
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29
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1.95
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3.0
40
90
1
177
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30
22
20
1.98
19293945--19294092
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3.1
48
92
0
242
29
24
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1.84
19295304--19295347
23
1.9
23
85
0
61
45
11
6
36
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19295782--19295823
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59
36
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0
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1.45
19297694--19297732
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1.9
21
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62
2
12
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79
1.00
19300176--19300227
21
2.5
22
93
6
90
26
28
19
25
1.98
19301811--19301862
16
3.2
16
94
0
86
28
0
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34
1.58
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2.1
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2.0
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51
0
0
48
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0
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2
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0
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2.3
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19345202--19345228
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2.1
13
100
0
54
33
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0
59
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19344182--19345360
144
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1702
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59
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14
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0
0
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75
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0
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5
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5
1.37
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19
2.1
19
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55
10
10
2
77
1.08
19352670--19352711
9
4.7
9
90
0
66
38
0
35
26
1.57
19355220--19355273
18
2.9
18
77
20
58
25
1
1
70
1.07
19355216--19355279
19
3.4
18
74
20
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29
1
1
67
1.09
19358646--19358679
17
2.0
17
100
0
68
23
29
11
35
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21
2.2
21
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0
56
43
32
2
21
1.65
19362261--19362316
28
2.0
28
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33
7
21
37
1.81
19362972--19363019
14
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14
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53
41
0
0
58
0.98
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30
2.1
30
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16
1.92
19369194--19369237
18
2.4
18
88
0
70
77
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9
6
1.13
19369261--19369330
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27
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0
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18
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6.0
145
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2
0
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0.94
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29
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1.53
19369409--19370266
425
2.0
430
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1410
29
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0
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0
34
0
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0.93
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3
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3
100
0
50
36
0
0
64
0.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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4
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0
0
26
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22
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59
73
0
0
26
0.83
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2.7
33
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1
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21
24
1.89
19378006--19378117
33
3.4
32
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7
111
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25
1.90
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2
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27
17
28
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0
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234
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1.71
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2.0
22
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9
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42
1.60
19390774--19390829
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2.4
24
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2
0
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1.19
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1
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1.29
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12
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15
53
34
0
4
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1.15
19398750--19398784
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0
0
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22
4.1
22
69
20
65
35
3
4
55
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19398911--19398974
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2.5
25
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85
25
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0
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2.4
22
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0
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49
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18
3
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74
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2.1
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1.40
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348
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19413472--19413509
19
2.0
20
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5
60
26
7
0
65
1.19

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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