Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  40  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.94
Indices
Period
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Score
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1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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89
53
5
4
35
1.46
12993889--12993942
18
2.9
18
86
2
72
55
0
3
40
1.17
12994127--12994165
19
1.9
19
85
10
51
61
0
2
35
1.10
12995121--12995200
30
2.7
30
90
3
117
42
5
1
51
1.31
13008377--13008452
11
7.2
10
80
12
64
76
1
9
13
1.08
13008377--13008431
22
2.5
22
88
5
85
76
0
7
16
1.00
13008377--13008443
5
12.4
5
77
14
62
76
0
8
14
1.02
13008376--13008426
17
3.0
17
82
8
68
74
0
7
17
1.05
13018097--13018127
16
1.9
16
93
0
53
32
0
3
64
1.09
13019236--13019293
18
3.2
18
85
0
80
29
10
17
43
1.82
13021383--13021407
12
2.1
12
100
0
50
36
16
24
24
1.94
13028908--13028973
33
2.0
33
100
0
132
39
9
6
45
1.61
13032240--13032282
23
1.9
22
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4
59
48
27
6
16
1.71
13032945--13033115
43
4.0
43
73
13
129
33
25
15
25
1.95
13041313--13041397
4
20.8
4
75
4
71
64
4
25
4
1.33
13049734--13049793
10
6.0
10
84
11
79
68
1
10
20
1.27
13053710--13053761
10
4.8
10
82
15
59
51
26
3
17
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13053719--13053761
23
1.9
22
90
4
68
51
27
4
16
1.64
13054431--13054596
43
3.9
42
77
11
158
31
23
16
27
1.96
13054431--13054589
86
1.9
85
83
9
207
32
23
16
27
1.96
13054642--13054699
28
2.1
28
96
0
107
27
18
20
32
1.97
13056698--13056757
16
3.8
16
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16
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60
1
1
36
1.17
13057831--13057891
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3.4
18
90
0
104
29
8
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40
1.82
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12
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0
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6
29
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1.78
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0
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0
0
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50
2.0
50
88
3
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41
15
10
32
1.82
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15
100
0
58
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0
0
24
0.80
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12
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28
4
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1.29
13092642--13092689
12
3.8
12
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15
51
22
2
14
60
1.45
13092638--13092694
27
2.1
27
96
0
105
28
1
14
56
1.48
13092638--13092679
12
3.1
14
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19
52
28
0
11
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23
2.1
23
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4
0
59
1.17
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0
0
64
0.94
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56
58
0
0
41
0.98
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2.2
19
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8
61
54
0
2
43
1.12
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3
11.3
3
93
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30
0
0
69
0.88
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3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
13106663--13106718
21
2.7
21
88
0
76
28
32
7
32
1.84
13107406--13107457
15
3.5
14
80
12
50
76
1
13
7
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13107781--13107816
18
1.9
19
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5
56
38
0
27
33
1.57
13108378--13108499
40
3.1
38
70
16
106
28
16
20
34
1.94
13111140--13111190
27
1.9
27
88
4
77
56
0
1
41
1.10
13113662--13113700
19
2.1
19
85
4
53
51
0
7
41
1.31
13127530--13127576
12
4.2
12
76
15
55
63
8
0
27
1.23
13127532--13127572
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2.0
21
100
0
82
68
7
0
24
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2.0
32
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8
80
36
0
4
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1.18
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25
1.87
13130562--13130586
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2.1
12
100
0
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36
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24
24
1.94
13130516--13130632
58
2.0
58
94
0
207
38
14
23
23
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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