Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  48  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15396416--15396508
20
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1
32
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15396416--15396508
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9
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62
4
1
32
1.22
15396416--15396508
19
4.9
19
76
9
91
62
4
1
32
1.22
15397143--15397223
10
8.2
10
71
8
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32
1
3
62
1.20
15397178--15397242
30
2.2
30
83
5
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4
3
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1.34
15415617--15415655
12
3.0
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24
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29
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1.9
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29
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15
81
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2
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2.0
52
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118
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2
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2.0
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2
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61
3.1
61
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2
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0
0
60
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1.9
120
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1.40
15703138--15703172
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2.0
17
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5
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0
0
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0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15703001--15703186
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1
4
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1.33
15703126--15703396
143
1.9
147
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4
478
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2
3
46
1.34
15703281--15703315
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2.0
17
88
5
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0
0
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2.1
45
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1
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16
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0
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36
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2.0
21
95
0
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34
37
0
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1.57
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50
2.5
51
88
5
182
37
15
21
25
1.92
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7.8
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17
28
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1.98
15709095--15709335
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2.6
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93
0
401
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17
28
27
1.98
15709407--15709521
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2.7
43
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4
171
30
14
26
27
1.95
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24
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29
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2.5
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29
25
16
28
1.97
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133
28
24
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1.97
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2.2
116
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0
0
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14
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168
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43
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158
27
12
27
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1.93
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1.9
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24
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2.0
22
100
0
90
44
8
13
33
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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262
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17
29
23
1.97
15728167--15728380
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4.6
46
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28
17
29
23
1.97
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2.6
47
82
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126
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18
29
23
1.97
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5
14
1.00
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5
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1.03
15733270--15733353
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5.2
16
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73
77
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2
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1.36
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22
3.2
22
72
14
54
69
5
7
17
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15772760--15772819
3
20.0
3
73
13
52
66
3
3
26
1.23
15772739--15772818
30
2.6
28
80
11
70
67
3
6
22
1.29
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30
1.96
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17
30
1.96
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181
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28
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17
31
1.96
15774927--15775049
45
2.8
43
87
2
165
29
23
16
30
1.96
15775063--15775170
44
2.4
44
81
9
130
27
28
13
29
1.95
15775055--15775469
178
2.3
177
87
1
569
25
26
18
30
1.98
15775475--15775683
44
4.8
43
70
5
134
26
22
21
29
1.99
15775674--15776024
45
7.9
45
70
8
225
25
26
18
29
1.98
15775638--15776024
133
2.9
132
87
2
560
25
25
19
29
1.98
15781986--15782018
3
11.0
3
100
0
66
33
0
33
33
1.58
15782140--15782181
17
2.5
17
80
7
50
59
0
4
35
1.19
15782142--15782180
20
2.0
20
89
0
60
61
0
5
33
1.18
15782790--15782814
13
1.9
13
100
0
50
20
56
16
8
1.65
15786694--15786734
15
2.8
15
85
3
57
24
0
7
68
1.15
15788560--15788602
22
2.0
22
85
0
59
37
6
11
44
1.68
15788750--15788791
21
2.0
20
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35
2
4
57
1.33
15790646--15790725
40
2.0
40
97
0
151
13
10
23
52
1.71
15800723--15800760
12
3.0
13
78
21
53
65
0
2
31
1.06
15806106--15806172
16
4.6
15
74
22
63
56
0
0
43
0.99
15806134--15806176
11
4.1
11
79
11
54
60
0
0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15806116--15806170
20
3.0
19
87
10
71
58
0
0
41
0.98
15809882--15810434
271
2.0
271
95
0
980
45
15
14
24
1.84
15815695--15815760
25
2.6
25
90
4
98
21
27
21
30
1.98
15817525--15817588
21
2.9
22
79
6
76
40
25
18
15
1.90
15817525--15817590
23
3.0
23
80
6
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40
24
19
15
1.90
15817962--15818019
15
3.8
15
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2
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51
12
0
36
1.39
15819287--15819333
5
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5
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2
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57
0
0
42
0.98
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13
2.3
13
100
0
60
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6
6
40
1.56
15842980--15843042
30
2.1
30
96
0
117
26
0
7
65
1.20
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20
2.0
21
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4
59
66
7
4
21
1.35
15846073--15846110
18
2.1
18
100
0
76
52
15
5
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1.64
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16
2.1
16
94
0
57
27
24
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45
1.68
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21
2.5
21
82
11
63
63
3
0
32
1.12
15863216--15863257
21
2.1
20
86
8
59
33
0
2
64
1.07
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15
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35
14
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41
1.75
15870587--15870628
19
2.4
17
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11
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26
2
2
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1.13
15872842--15872873
16
2.0
16
100
0
64
25
6
18
50
1.70
15878999--15879263
132
2.0
132
93
1
451
29
30
16
24
1.96
15880227--15880265
16
2.4
16
86
4
51
51
25
0
23
1.49
15881266--15881310
17
2.6
17
78
3
54
31
31
20
17
1.96
15882271--15882360
19
4.5
20
69
20
55
41
2
2
54
1.25
15882315--15882344
8
3.8
8
95
0
51
36
3
0
60
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15886356--15886439
25
3.4
25
76
12
84
38
19
25
17
1.93
15886350--15886445
25
3.8
26
74
16
78
38
17
25
18
1.93
15889102--15889126
10
2.5
10
100
0
50
92
0
0
8
0.40
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18
14.6
18
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16
160
38
15
11
35
1.84
15890484--15890670
72
2.6
71
80
6
191
38
14
11
35
1.82
15890837--15891071
45
5.2
45
90
0
317
39
20
20
20
1.93
15891480--15891526
5
9.2
5
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4
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2
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0
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9
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20
11
0
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1.20
15892886--15892920
17
2.0
18
94
5
63
20
11
0
68
1.20

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352