Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  305  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99856086--99856144
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21
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44
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2.2
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0
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2.0
21
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2.0
42
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26
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0
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2.3
18
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0
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4
38
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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0
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23
82
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0
33
33
1.58
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21
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1.99
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23
21
24
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1.99
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1.9
21
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0
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30
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0
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3.3
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24
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2.0
30
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0
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37
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0
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0
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0
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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12.7
3
88
0
58
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5
0
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1.17
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72
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32
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4
60
1.34
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2.5
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35
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28
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34
1.80
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0
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1.07
100040477--100040540
28
2.2
30
83
5
87
59
0
1
39
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100040523--100040557
16
2.2
16
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0
61
71
0
5
22
1.07
100040490--100040547
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2.0
28
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3
71
58
0
1
39
1.08
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0
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1.20
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0
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1.20
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1
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1.19
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2.6
92
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8
257
34
8
19
37
1.82
100042350--100042375
12
2.2
12
100
0
52
53
15
7
23
1.67
100045014--100045059
20
2.3
18
82
17
56
13
13
0
73
1.09
100049005--100049048
23
2.0
22
86
4
61
34
13
9
43
1.76
100050100--100050140
22
2.0
20
90
9
64
41
0
0
58
0.98
100054212--100054247
2
18.0
2
100
0
72
50
0
50
0
1.00
100057392--100057434
21
2.0
21
90
0
68
25
18
11
44
1.84
100065260--100065462
104
2.0
104
80
3
230
26
21
28
23
1.99
100069357--100069540
42
4.4
42
79
0
179
26
25
33
15
1.95
100073206--100073267
26
2.3
26
83
8
72
74
9
12
3
1.19
100078728--100078755
10
2.8
10
100
0
56
60
0
7
32
1.24
100080218--100080259
23
1.9
23
85
9
61
21
23
23
30
1.99
100081707--100081790
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2.0
43
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33
1.94
100088616--100088768
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43
79
8
152
28
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32
1.96
100094037--100094069
7
4.9
7
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3
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57
0
0
42
0.98
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28
2.1
28
100
0
116
31
10
10
48
1.71
100102398--100102444
18
2.8
18
81
15
64
55
0
2
42
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100102638--100102667
14
2.1
15
93
6
53
63
0
3
33
1.11
100103855--100103973
60
2.0
60
91
0
193
36
0
10
52
1.37
100103956--100104130
72
2.2
79
78
18
229
29
1
14
55
1.47
100103995--100104108
34
3.2
34
63
18
88
32
1
12
53
1.48
100103983--100104159
72
2.5
72
94
1
302
29
1
14
55
1.46
100104032--100104146
38
3.1
38
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14
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28
1
14
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27
2.1
27
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0
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1.90
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2.0
21
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43
2
2
51
1.28
100120258--100120303
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2.3
21
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65
2
10
21
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100
0
62
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0
0
64
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1.9
17
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6
30
1.47
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20
1.9
20
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0
67
26
21
5
47
1.71
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31
2.0
31
87
9
90
50
18
9
21
1.75
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12
5.5
12
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0
51
22
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1.61
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18
2.3
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12
50
21
7
14
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1.63
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16
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0
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23
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1.72
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62
2.0
62
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3
185
24
8
20
46
1.79
100129869--100129919
15
3.4
15
77
0
57
23
9
29
37
1.87
100131579--100131680
40
2.5
40
90
0
159
23
9
20
46
1.80
100131659--100131715
28
2.2
25
87
9
78
24
5
15
54
1.62
100132357--100132458
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5.0
21
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31
40
13
14
1.85
100133523--100133575
27
1.9
28
88
11
83
45
3
18
32
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100134085--100134125
12
3.4
12
86
10
57
26
7
9
56
1.58
100134301--100134379
34
2.3
34
95
2
140
32
8
1
56
1.38
100134498--100134566
21
3.2
22
78
12
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34
1
8
55
1.40
100134616--100134665
24
2.1
24
84
0
64
38
0
4
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1.17
100134629--100134693
24
2.7
24
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32
3
4
60
1.33
100134646--100134723
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2.1
38
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97
32
5
6
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1.47
100134796--100134858
22
3.0
21
79
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9
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100134798--100134858
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2.9
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4
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1.52
100147225--100147260
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2.6
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0
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27
11
2
58
1.46
100147169--100147792
89
7.4
86
73
15
426
26
18
19
35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352