Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  200  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66072187--66072304
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1.9
58
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10
137
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1
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38
1.63
66072227--66072307
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2.8
28
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3
117
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1
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1.59
66072363--66072735
126
3.0
125
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3
507
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1.86
66076216--66076250
18
1.9
18
100
0
70
40
0
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1.57
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2.9
30
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0
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14
17
36
31
1.90
66077846--66077929
25
3.3
24
70
14
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2
28
1.26
66077841--66077949
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2.1
53
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1
184
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31
1.29
66078606--66078654
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2.0
24
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73
24
24
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1.76
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2.3
71
100
0
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12
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26
0
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21
2.9
21
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26
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1.61
66086165--66086213
21
2.3
20
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28
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2
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1.58
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18
2.4
18
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0
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20
25
9
44
1.81
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3.5
126
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0
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17
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30
2.0
30
93
0
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1.69
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1.59
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5
119
20
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14
1.92
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20
1.9
21
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53
41
12
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38
1.72
66102460--66102550
24
3.7
24
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94
25
21
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66102701--66102738
20
1.9
20
88
0
58
39
7
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39
1.73
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2.0
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20
33
1.89
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17
2.4
17
86
0
53
37
30
15
17
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66110732--66110833
51
2.0
51
88
1
152
48
10
9
31
1.71
66111974--66112029
14
4.0
14
83
4
69
41
5
30
23
1.76
66111975--66112038
28
2.3
28
86
5
85
39
3
31
26
1.72
66114748--66114923
43
4.1
43
77
11
166
30
28
16
24
1.96
66115603--66115657
27
2.0
27
100
0
110
21
25
10
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1.86
66115969--66115997
14
2.0
15
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6
51
51
20
0
27
1.47
66116210--66116332
45
2.7
45
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2
176
40
27
8
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1.83
66117857--66117896
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2.0
20
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0
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35
22
0
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1.54
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2.4
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3
173
27
23
2
47
1.62
66123503--66123651
42
3.5
42
82
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178
29
16
23
30
1.96
66126506--66126562
28
2.0
29
82
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71
40
3
24
31
1.72
66148858--66149001
40
3.5
40
80
3
135
31
24
17
26
1.97
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2.1
17
90
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56
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0
0
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1.00
66164601--66164637
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0
0
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1.00
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50
0
0
50
1.00
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2.8
46
90
0
208
20
21
28
29
1.98
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6.2
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95
1
974
29
29
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32
1.87
66170959--66171548
49
12.3
49
95
1
999
30
28
8
32
1.87
66175158--66175453
40
7.5
40
85
2
386
25
27
22
25
2.00
66175158--66175453
79
3.8
80
90
3
458
25
27
22
25
2.00
66181832--66181869
12
3.0
13
85
14
53
10
31
0
57
1.32
66183279--66183322
22
2.0
22
91
4
72
29
22
22
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66188605--66188779
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3.8
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13
216
20
20
29
29
1.98
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12
2.2
12
100
0
54
7
22
44
25
1.79
66191553--66191653
43
2.4
41
84
10
134
32
26
15
24
1.96
66193454--66193564
43
2.6
43
79
0
132
25
13
19
41
1.88
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39
4.1
39
90
1
221
24
28
20
27
1.99
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2.9
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7
163
28
15
23
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1.96
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5.7
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25
21
26
25
2.00
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2.2
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301
26
21
26
25
1.99
66224625--66224849
40
5.7
40
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305
25
21
26
26
2.00
66226501--66226623
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28
92
2
185
33
27
12
26
1.92
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21
20
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1.98
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20
27
30
1.98
66242474--66242645
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93
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0
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22
20
27
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1.99
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21
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1.99
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16
1.11
66250605--66250666
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13
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0
16
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66265058--66265118
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31
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36
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2.0
43
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12
108
29
29
17
22
1.97
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2.5
14
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11
0
26
1.30
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15
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85
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0
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25
15
28
1.96
66269292--66269438
47
3.3
47
72
16
168
32
23
14
28
1.95
66275488--66275537
22
2.2
23
85
7
66
18
20
18
44
1.88
66275500--66275543
22
2.0
22
81
0
52
15
18
25
40
1.90
66275544--66275587
20
2.2
20
91
0
70
13
22
22
40
1.89
66275575--66275644
25
2.7
27
78
12
85
18
18
17
45
1.85
66276894--66276918
12
2.1
12
100
0
50
16
8
8
68
1.38
66282690--66282744
15
3.8
15
85
2
69
1
21
1
74
1.01
66284876--66284908
14
2.4
14
94
0
57
15
6
3
75
1.11
66284865--66284919
25
2.2
24
90
3
83
16
3
3
76
1.07
66288883--66288945
33
1.9
33
84
12
85
12
25
6
55
1.60
66288943--66288998
21
2.7
21
72
5
51
8
17
1
71
1.21
66288942--66288998
14
4.1
14
75
16
57
8
17
1
71
1.19
66288963--66289052
12
7.6
12
70
15
53
10
20
1
68
1.24
66290105--66290140
12
3.0
12
87
0
54
13
8
2
75
1.15
66290090--66290175
39
2.3
37
78
8
93
12
6
5
74
1.20
66290105--66290169
28
2.3
28
72
2
67
15
6
3
75
1.12
66290144--66290173
10
3.0
10
95
0
51
10
0
3
86
0.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66291748--66291812
20
3.3
19
73
16
51
38
16
21
23
1.93
66292105--66292152
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
66303371--66303423
14
4.0
13
81
11
63
18
7
3
69
1.28
66306537--66306574
11
3.5
11
89
3
60
7
2
5
84
0.86
66306529--66306571
19
2.3
19
88
8
61
9
4
6
79
1.06
66306937--66306984
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
66312708--66312745
19
2.0
19
100
0
76
31
31
0
36
1.58
66313421--66313463
18
2.3
19
84
11
54
27
4
0
67
1.10
66315436--66315489
20
2.7
20
82
0
63
24
20
18
37
1.94
66315436--66315509
30
2.5
30
86
8
98
21
20
18
39
1.93
66315436--66315500
20
3.2
20
71
16
53
23
21
16
38
1.93
66319355--66319417
22
2.8
22
81
18
76
77
3
14
4
1.05
66319372--66319409
10
3.7
10
89
3
58
86
2
7
2
0.74
66320431--66320549
12
9.6
12
72
16
66
72
4
16
6
1.23
66320435--66320537
18
5.6
18
75
7
82
71
3
16
7
1.24
66320431--66320537
6
17.7
6
69
8
65
71
3
16
7
1.23
66320497--66320535
14
2.8
15
88
11
57
74
0
17
7
1.05
66320552--66320614
33
1.9
33
84
12
85
53
6
26
12
1.62
66322002--66322049
26
1.9
25
83
8
62
33
0
4
62
1.14
66322726--66322758
7
4.7
7
96
0
57
18
51
0
30
1.46
66325414--66325582
45
3.7
45
77
16
195
21
21
28
28
1.98
66325411--66325579
92
1.8
92
93
2
295
21
21
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66332965--66333137
46
3.7
46
80
13
219
21
21
28
28
1.98
66332962--66333132
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
66335192--66335299
39
2.8
40
79
6
114
25
29
20
24
1.99
66343519--66343590
34
2.1
35
82
7
85
22
26
9
41
1.84
66345058--66345114
26
2.2
26
81
9
62
26
17
19
36
1.94
66357387--66357474
39
2.2
40
89
4
142
26
26
23
23
2.00
66363818--66363879
25
2.5
26
89
7
94
43
14
14
27
1.84
66366821--66366991
93
1.8
93
93
0
297
21
21
29
28
1.98
66366827--66366996
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3.7
46
78
13
204
21
21
28
28
1.99
66369987--66370031
17
2.7
15
86
13
54
77
2
0
20
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352