Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  41  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13132573--13132661
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2.0
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2.7
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31
17
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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28
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24
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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32
29
18
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1.96
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162
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27
16
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13329468--13329496
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15
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51
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0
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1.47
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2.0
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0
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10
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2.0
31
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0
88
58
4
0
37
1.20
13355463--13355633
46
3.6
47
87
7
215
19
22
15
42
1.89
13355511--13355648
46
3.0
46
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4
217
21
23
15
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13357732--13357766
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18
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0
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0
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16
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20
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20
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13
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13
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0
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0
13
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0
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11
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0
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13385654--13385702
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27
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29
14
28
28
1.95
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39
3.4
39
74
11
116
28
27
20
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
0
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0
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2
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1.34
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23
1.9
23
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0
70
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4
2
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1.28
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2
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0
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53
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0
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15
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0
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2.1
21
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0
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0
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95
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0
288
46
8
19
25
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13481650--13481690
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2.0
21
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0
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14
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1.92
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15
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15
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2
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0
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0
0
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2
0
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0
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19
2.6
18
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18
53
33
4
0
62
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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