Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  17  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5423717--5423797
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42
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0
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42
1.9
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94
0
144
58
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1.49
5438869--5438911
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4
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0
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2.2
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0
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0
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2.1
22
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38
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38
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13
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2.1
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19
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2.0
87
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20
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2.0
15
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0
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46
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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2.1
32
100
0
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1.9
30
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0
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2
2
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2
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2.0
62
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2.3
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2.0
40
100
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75
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11
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26
10
28
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25
2.1
25
85
0
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36
9
17
36
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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2.1
12
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23
2.0
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0
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0
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0
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21
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2.2
24
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0
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2
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0.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5620171--5620234
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0
0
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20
0
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24
7.3
24
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10
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17
32
24
25
1.97
5664114--5664254
75
1.9
75
84
0
192
17
34
23
24
1.96
5664071--5664256
27
7.2
27
74
12
117
17
32
24
25
1.97
5675539--5675858
46
7.0
45
83
8
369
42
13
23
20
1.87
5675549--5675858
92
3.4
92
87
2
435
42
13
23
20
1.88
5675549--5675858
138
2.2
138
89
1
469
42
13
23
20
1.88
5677631--5677806
46
3.8
46
77
10
178
28
27
21
22
1.99
5677682--5677825
46
3.1
44
69
19
105
29
26
20
23
1.99
5679504--5679609
13
8.1
14
71
16
68
33
18
2
44
1.65
5679546--5679625
26
3.1
26
78
3
72
33
20
6
40
1.77
5680059--5680104
17
2.6
18
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6
58
45
17
4
32
1.68
5684735--5685028
24
12.0
24
90
4
417
14
34
24
25
1.94
5692510--5692561
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
5692385--5692682
120
2.5
120
91
3
483
42
2
5
50
1.38
5692423--5692621
66
3.2
62
68
22
166
40
3
6
49
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5692896--5692947
16
3.2
16
97
0
95
38
34
0
26
1.57
5694995--5695058
13
4.9
13
78
0
74
31
1
26
40
1.65
5694995--5695058
26
2.5
26
84
0
83
31
1
26
40
1.65
5695286--5695346
19
3.1
19
81
9
70
50
0
1
47
1.10
5701328--5701379
26
2.0
26
84
0
68
25
13
21
40
1.89
5701339--5701393
26
2.1
26
86
6
76
29
10
16
43
1.82
5703902--5703945
22
2.0
22
100
0
88
9
27
18
45
1.79
5704414--5704510
44
2.2
45
85
7
135
38
19
27
14
1.91
5707845--5707895
23
2.2
23
100
0
102
33
15
7
43
1.76
5708090--5708251
42
3.7
42
84
9
191
29
26
14
29
1.95
5708173--5708341
47
3.6
46
86
3
194
29
27
15
27
1.96
5708132--5708341
95
2.3
94
82
8
236
29
26
15
28
1.96
5708363--5708480
31
3.8
31
86
4
175
26
27
19
27
1.99
5708363--5708480
62
1.9
62
91
3
193
26
27
19
27
1.99
5708456--5708638
56
3.5
50
82
9
231
25
21
16
35
1.95
5711186--5711213
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
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19
2.4
19
100
0
90
37
0
42
20
1.52
5713424--5713644
67
3.4
65
77
6
214
32
14
28
24
1.95
5723834--5723885
23
2.3
23
86
6
70
51
11
1
34
1.49
5729602--5729829
114
2.0
114
90
1
359
35
5
12
46
1.65
5734259--5734316
30
1.9
30
89
0
89
41
3
24
31
1.71
5734528--5734559
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5734654--5734895
50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
5734654--5734903
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
5741000--5741048
15
3.3
15
74
23
50
71
4
2
22
1.13
5741019--5741069
18
2.9
18
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8
61
70
1
3
23
1.14
5742195--5742263
27
2.6
27
95
2
122
14
7
42
36
1.73
5742562--5742663
42
2.4
42
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3
125
28
18
19
33
1.96
5742686--5742962
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3.2
85
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10
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28
21
17
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1.96
5742943--5743228
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6.7
44
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8
144
25
22
21
30
1.98
5742980--5743272
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42
73
12
195
26
21
21
31
1.98
5742975--5743272
44
6.8
45
72
12
221
25
21
20
31
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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