Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  96  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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5
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17
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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40
1.60
30582890--30583074
40
4.7
40
82
8
218
23
22
28
25
1.99
30582943--30583107
79
2.1
79
84
6
210
25
21
27
25
1.99
30587516--30587694
46
3.9
47
86
8
239
35
12
26
26
1.92
30587516--30587694
93
2.0
89
85
8
245
35
12
26
26
1.92
30587900--30588049
37
4.1
37
93
0
246
23
18
30
27
1.98
30594907--30595051
40
3.6
40
85
4
193
25
24
26
23
2.00
30597820--30598003
40
4.6
41
82
9
213
24
22
27
25
2.00
30597820--30598001
79
2.3
80
83
6
219
24
23
27
24
2.00
30597858--30598036
79
2.3
79
78
7
195
27
21
26
25
1.99
30599506--30599589
32
2.6
32
79
5
98
27
3
19
50
1.64
30601004--30601048
19
2.3
19
80
3
54
53
11
8
26
1.65
30614678--30614732
30
1.9
30
88
7
87
38
3
14
43
1.63
30618999--30619061
31
2.0
31
90
0
99
33
9
9
47
1.68
30619790--30619834
22
2.0
23
82
4
56
71
4
2
22
1.15
30625254--30625309
21
2.7
21
97
0
103
26
8
35
28
1.87
30625254--30625319
21
3.3
19
89
6
62
27
10
36
25
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30627314--30627473
32
5.0
32
91
0
266
45
10
12
32
1.75
30627314--30627473
64
2.5
64
95
0
293
45
10
12
32
1.75
30632894--30632931
19
2.1
19
90
5
60
28
23
18
28
1.98
30634698--30634998
89
3.4
88
84
5
385
38
21
8
31
1.84
30635359--30635437
28
2.8
27
79
7
86
31
3
1
63
1.20
30635368--30635449
20
4.2
19
79
6
83
28
4
1
65
1.20
30636804--30636902
40
2.5
40
75
6
103
22
27
15
35
1.94
30649558--30649741
39
4.7
38
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4
233
29
29
21
19
1.97
30649814--30649878
28
2.3
28
91
0
112
29
20
9
41
1.83
30656008--30656269
39
6.7
38
87
3
335
29
29
21
19
1.97
30656342--30656423
28
2.9
28
81
3
94
29
24
9
36
1.87
30660964--30661194
89
2.6
89
88
0
329
35
19
12
32
1.90
30661288--30661359
32
2.1
35
82
7
87
68
2
2
26
1.17
30661496--30661552
20
2.9
20
74
12
55
28
8
5
57
1.50
30661562--30661664
9
11.2
9
75
18
79
31
1
1
65
1.15
30661562--30661664
19
5.6
18
71
19
79
31
1
1
65
1.15
30663784--30663959
46
3.8
46
79
12
216
20
19
29
30
1.97
30663781--30663951
93
1.8
93
94
0
306
20
20
29
29
1.98
30666129--30666282
40
3.9
39
92
4
238
29
20
3
46
1.68
30667384--30667408
13
1.9
13
100
0
50
8
28
16
48
1.74
30667391--30667476
44
2.0
43
90
6
138
26
27
15
30
1.96
30667574--30668155
205
2.8
205
92
1
965
29
22
18
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
30680587--30680743
39
4.0
39
91
2
233
29
19
3
47
1.65
30680602--30680746
40
3.7
39
93
2
236
31
17
2
48
1.61
30680589--30680743
79
2.0
79
92
2
258
29
19
3
47
1.65
30683243--30683357
18
6.3
18
75
4
106
40
16
8
33
1.79
30683253--30683360
36
3.0
36
82
1
119
39
15
8
36
1.78
30683366--30683437
18
3.9
18
70
10
56
44
13
9
31
1.77
30683383--30683432
18
2.7
19
75
6
57
50
10
8
32
1.65
30688240--30688293
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24
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0
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20
24
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48
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4.3
40
75
10
154
35
21
20
22
1.96
30688414--30688631
116
1.9
116
84
5
298
33
21
20
24
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352