Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  16  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4999305--4999358
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2.5
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1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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210
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28
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22
30
1.97
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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2.0
25
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53
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14
27
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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69
1.33
5240475--5240517
21
2.0
21
86
0
59
30
2
4
62
1.28
5247330--5247363
16
2.1
16
100
0
68
55
0
5
38
1.24
5247878--5247915
13
3.0
13
84
3
51
73
0
0
26
0.83
5252009--5252053
22
2.0
22
95
0
81
28
8
28
33
1.87
5259873--5259951
35
2.3
35
88
4
115
21
17
10
50
1.75
5264453--5264557
33
3.2
33
97
2
201
40
8
11
40
1.72
5279656--5279711
29
1.9
29
81
0
67
50
8
0
41
1.34
5282299--5282349
26
1.9
27
88
4
77
33
1
0
64
1.05
5282641--5282680
21
2.0
19
90
9
62
45
5
5
45
1.47
5284692--5284776
44
1.9
44
87
0
125
38
16
21
23
1.92
5290590--5290713
62
2.0
65
87
7
184
30
4
8
56
1.49
5293238--5293309
30
2.4
30
77
13
76
31
13
8
45
1.74
5296047--5296084
19
2.0
19
85
10
51
42
5
5
47
1.48
5297941--5297987
24
1.9
25
95
4
87
27
10
4
57
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5300828--5301175
186
1.9
186
85
1
482
29
18
12
39
1.88
5310790--5310814
12
2.1
12
100
0
50
84
0
0
16
0.63
5317073--5317135
13
5.2
12
72
16
58
63
0
1
34
1.04
5318459--5318516
29
2.0
29
93
0
98
31
10
17
41
1.83
5335179--5335226
26
1.9
24
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8
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64
6
0
29
1.18
5335301--5335333
15
2.1
16
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11
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69
0
0
30
0.88
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90
2.1
87
84
3
233
33
15
11
39
1.84
5336887--5336941
19
2.8
20
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5
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61
3
1
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1.24
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20
2.4
20
92
0
78
58
0
0
41
0.98
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9
9.4
9
69
17
51
60
1
3
34
1.20
5336962--5337062
19
5.2
19
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16
82
59
0
2
36
1.19
5336967--5337062
30
3.2
29
75
10
95
57
1
3
38
1.22
5336967--5337023
11
5.5
11
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56
1
1
40
1.20
5336982--5337098
59
2.0
59
84
3
155
59
1
5
32
1.31
5337298--5337363
20
3.3
20
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31
1
3
63
1.19
5337318--5337440
65
1.9
64
82
11
153
30
2
1
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1.15
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15
2.0
15
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0
51
30
0
3
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1.07
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82
2.0
81
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294
24
21
17
37
1.94
5345512--5345538
13
2.1
13
100
0
54
55
0
0
44
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56
2.0
56
100
0
226
29
23
14
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1.93
5363751--5363783
16
2.1
16
100
0
66
45
0
6
48
1.27
5374728--5374767
18
2.2
18
91
8
64
67
15
0
17
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5374850--5374912
30
2.1
30
93
0
108
57
11
3
28
1.49
5376189--5376237
25
2.0
25
100
0
98
32
12
10
44
1.75
5378113--5378156
19
2.4
18
84
3
52
34
6
0
59
1.24
5378144--5378184
22
1.9
21
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5
64
39
2
2
56
1.26
5378177--5378222
24
1.9
24
86
0
65
32
10
4
52
1.56
5385136--5385160
8
3.1
8
100
0
50
0
36
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26
1.9
26
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4
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2
10
10
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13
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3
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0
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2.3
24
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1.16
5422478--5422502
13
1.9
13
100
0
50
8
0
28
64
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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