Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  79  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24907276--24907308
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9
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0
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22
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0
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0
0
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50
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0
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28
28
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1.98
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20
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54
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36
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3.4
40
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157
32
24
18
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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17
25
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1.9
31
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0
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1.9
16
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53
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3
40
1.34
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2.2
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12
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16
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2.0
20
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2
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17
2.6
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52
55
0
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39
1.20
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34
2.0
32
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3
12
12
1.23
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22
2.3
22
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1.09
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1.9
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10
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2.0
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2.1
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1.54
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18
3.2
18
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18
66
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10
1
13
1.15
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80
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68
75
9
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11
1.16
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2.0
51
100
0
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15
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2.7
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5
179
43
5
14
36
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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38
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2.7
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0
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0
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0
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1.99
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26
24
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17
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11
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69
0
2
27
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25097133--25097195
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0
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15
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0
3
31
1.08
25110933--25110982
21
2.3
22
89
6
75
34
30
24
12
1.91
25110908--25110994
21
4.0
23
75
10
74
37
25
20
16
1.93
25111366--25111423
15
3.8
15
88
2
89
51
12
0
36
1.39
25112701--25112734
5
6.4
5
87
12
50
58
0
0
41
0.98
25112700--25112727
12
2.3
12
100
0
56
57
0
0
42
0.99
25114717--25115087
134
2.8
133
79
5
365
30
17
18
33
1.94
25125652--25125711
6
9.7
6
82
13
61
18
3
0
78
0.89
25128724--25128763
13
3.1
13
79
13
55
30
0
2
67
1.04
25136823--25136860
19
2.0
19
89
0
58
52
0
5
42
1.24
25137404--25137468
20
3.1
22
71
20
59
38
1
1
58
1.17
25141795--25141905
17
6.5
17
72
20
72
42
3
1
52
1.29
25141811--25141945
68
2.0
69
86
1
191
40
4
3
51
1.40
25142742--25142805
31
2.1
31
100
0
128
29
35
12
21
1.91
25151139--25151170
8
4.0
8
100
0
64
62
0
25
12
1.30
25170143--25170324
96
1.9
96
84
7
242
24
31
18
25
1.98
25170247--25170458
46
4.5
48
79
13
203
22
31
17
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25173566--25173599
14
2.3
14
90
10
50
41
0
2
55
1.15
25175967--25176005
17
2.3
17
86
0
51
58
7
0
33
1.26
25177832--25177868
18
2.1
18
100
0
74
56
10
0
32
1.34
25186912--25186945
16
2.1
16
88
0
50
11
26
32
29
1.92
25186928--25187061
38
3.5
38
85
2
162
12
20
29
36
1.90
25187056--25187113
25
2.3
25
78
0
62
17
18
25
37
1.93
25190898--25190963
27
2.4
27
90
5
98
36
9
13
40
1.76
25190924--25190976
27
2.0
27
84
0
70
37
9
16
35
1.82
25191796--25191848
28
1.9
28
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11
65
49
11
9
30
1.70
25202584--25202681
40
2.5
38
83
8
126
36
37
12
13
1.82
25204744--25204812
26
2.7
26
86
4
95
17
24
21
36
1.95
25204842--25204907
25
2.7
25
75
11
64
19
24
19
36
1.95
25213420--25213444
11
2.3
11
100
0
50
76
8
0
16
1.02
25216289--25216333
22
2.0
22
95
0
81
46
24
0
28
1.53
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20
2.0
20
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5
60
42
2
13
42
1.57
25219984--25220018
16
2.3
16
90
9
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74
2
5
17
1.14
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29
2.4
29
76
2
79
54
1
2
41
1.24
25238579--25239149
289
2.0
289
96
0
1061
32
11
18
37
1.86
25241104--25241273
39
4.4
39
87
3
220
28
14
24
32
1.95
25243213--25243257
22
2.0
23
91
4
74
37
28
15
17
1.91
25243949--25244046
21
4.7
21
85
0
97
51
14
9
25
1.72
25243949--25244046
42
2.3
42
91
0
151
51
14
9
25
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25251042--25251235
87
2.2
87
84
5
239
40
19
9
30
1.83
25251298--25251349
27
2.0
26
88
3
77
57
0
0
42
0.98
25251340--25251407
9
7.6
9
82
11
86
73
0
2
23
0.97
25251313--25251399
18
4.9
17
78
14
79
68
0
2
28
1.01
25251342--25251407
26
2.5
26
82
7
71
74
0
3
22
0.96
25251612--25251683
36
2.0
35
84
7
92
30
2
1
65
1.15
25251678--25251707
8
3.6
8
95
4
51
43
0
0
56
0.99
25251689--25251736
19
2.5
19
83
16
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45
2
0
52
1.12
25251774--25251994
87
2.5
88
82
5
259
31
8
22
37
1.85
25261764--25261802
18
2.2
18
100
0
78
64
12
5
17
1.46

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352