Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  85  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26716037--26716082
23
2.0
24
86
4
67
28
45
6
19
1.75
26716492--26716537
18
2.5
19
82
10
60
19
43
21
15
1.87
26725192--26725431
50
4.8
50
78
3
248
27
17
25
30
1.98
26725189--26725370
101
1.8
101
85
2
258
26
18
25
30
1.98
26725631--26725662
16
2.0
16
93
0
55
46
0
18
34
1.49
26730677--26730828
40
3.8
40
89
2
207
25
28
21
24
1.99
26735365--26735447
41
2.0
41
90
0
130
14
19
43
22
1.87
26739304--26739339
17
2.1
17
89
0
54
22
33
30
13
1.93
26740869--26740894
13
2.0
13
100
0
52
15
30
38
15
1.88
26741501--26741617
58
2.0
58
98
0
225
41
11
16
29
1.84
26742081--26742206
36
3.5
36
78
3
119
11
11
36
41
1.76
26742109--26742190
35
2.3
36
80
4
94
13
9
36
40
1.78
26752630--26752704
15
5.0
15
75
0
69
54
16
16
13
1.71
26763883--26763952
32
2.2
32
94
2
122
31
12
17
38
1.87
26764222--26764285
26
2.7
23
73
20
60
26
4
0
68
1.09
26764226--26764283
24
2.3
27
85
11
79
25
5
0
68
1.10
26764910--26764976
6
9.6
7
76
12
50
13
4
38
43
1.64
26764920--26764957
16
2.4
16
86
4
51
13
2
36
47
1.56
26765049--26765142
34
2.8
35
85
7
126
41
0
14
43
1.46
26765246--26766220
125
7.9
124
80
7
979
40
15
15
28
1.88
26765389--26765602
110
1.9
111
84
2
288
44
13
17
25
1.84
26765491--26766222
249
2.9
248
86
3
972
40
15
15
28
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26768871--26769015
40
3.6
40
84
4
184
25
24
26
24
2.00
26775663--26775736
38
2.0
36
92
5
121
33
13
22
29
1.93
26775668--26775746
38
2.1
38
83
4
99
32
12
25
29
1.93
26776903--26777029
39
3.2
37
77
15
121
25
24
25
25
2.00
26781012--26781055
18
2.4
18
88
0
61
45
9
18
27
1.79
26782583--26782635
26
2.1
26
80
16
67
69
1
1
26
1.09
26784072--26784105
6
5.7
6
92
0
59
17
35
17
29
1.93
26796507--26796594
44
2.0
44
97
0
167
48
4
19
27
1.68
26804280--26804315
18
2.1
17
89
5
54
44
0
8
47
1.33
26804865--26804904
21
2.0
20
85
5
53
30
5
0
65
1.14
26805003--26805102
46
2.2
46
81
12
116
39
4
4
53
1.39
26805016--26805116
47
2.2
46
79
12
107
44
3
2
48
1.36
26806003--26806069
34
1.9
35
87
3
100
44
14
8
31
1.76
26809986--26810052
19
3.6
17
77
16
55
35
0
2
61
1.12
26810613--26810653
21
1.9
22
90
5
66
12
7
12
68
1.39
26818704--26818728
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
26820313--26820360
21
2.3
20
82
13
53
62
6
2
29
1.31
26820319--26820361
21
2.0
21
86
9
59
58
6
2
32
1.38
26820465--26820494
12
2.5
12
100
0
60
43
13
16
26
1.85
26821068--26821154
34
2.5
34
80
7
95
42
12
14
29
1.83
26826137--26826206
28
2.5
28
88
9
99
27
14
27
31
1.95
26836974--26837058
33
2.6
33
88
0
116
22
14
47
16
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26841691--26841788
19
5.2
19
91
7
155
35
15
10
38
1.81
26841691--26841788
36
2.6
37
90
9
153
35
15
10
38
1.81
26842367--26843341
132
7.4
132
95
0
1635
27
23
17
31
1.97
26846789--26846824
19
1.9
19
94
5
65
41
11
22
25
1.86
26849795--26849863
19
3.5
19
84
9
93
39
15
8
36
1.79
26850269--26850336
31
2.2
30
80
10
75
2
23
1
72
1.07
26850609--26850648
21
2.0
21
95
5
73
17
27
10
45
1.80
26850602--26850652
10
4.8
12
75
24
60
17
27
13
41
1.87
26852056--26852095
10
3.7
11
87
12
57
82
10
0
7
0.84
26853456--26853510
16
3.4
16
78
9
58
38
5
1
54
1.34
26853486--26853523
14
2.8
14
84
15
53
36
5
0
57
1.21
26853888--26854039
69
2.3
66
85
5
189
30
5
9
53
1.56
26853888--26854059
66
2.5
69
80
8
201
31
5
10
52
1.59
26857286--26857317
14
2.1
16
88
11
50
18
25
12
43
1.85
26857894--26857993
50
2.0
50
100
0
200
40
12
24
24
1.88
26865443--26866306
90
9.6
90
90
0
1282
31
14
26
27
1.95
26867877--26867918
14
3.1
14
81
18
54
35
4
0
59
1.19
26868280--26868431
69
2.3
66
83
5
180
30
6
9
52
1.60
26869057--26869115
13
4.5
13
74
16
59
66
0
1
32
1.02
26869048--26869114
26
2.7
26
80
8
70
65
0
1
32
1.02
26872380--26872887
255
2.0
255
92
0
845
34
25
15
24
1.95
26888687--26888859
46
3.7
46
75
13
183
22
20
27
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26888684--26888854
93
1.8
93
92
2
290
22
20
28
29
1.98
26894191--26894359
46
3.7
46
77
10
191
23
20
26
28
1.99
26894184--26894354
93
1.8
93
92
0
288
23
21
26
28
1.99
26896956--26896998
21
2.0
21
86
0
59
30
32
13
23
1.93
26906254--26906292
16
2.4
17
86
4
53
71
2
23
2
1.10
26906247--26906327
37
2.2
37
82
12
105
71
1
23
3
1.09
26910883--26910943
30
2.0
30
87
0
86
31
22
4
40
1.75
26924628--26924745
40
3.0
40
93
0
200
28
28
18
23
1.98
26925431--26925466
18
2.0
18
100
0
72
33
16
11
38
1.84
26928333--26928372
20
2.0
20
100
0
80
25
20
15
40
1.90
26929395--26929517
63
2.0
63
85
3
167
21
24
26
26
2.00
26930092--26930171
17
4.9
16
74
11
74
75
1
20
3
1.03
26930099--26930172
33
2.3
31
80
13
78
75
1
18
4
1.03
26933873--26933957
25
3.4
24
82
6
89
18
21
21
38
1.93
26933962--26934168
111
1.9
111
80
4
247
24
17
25
32
1.97
26937570--26937626
16
3.6
16
95
0
87
29
0
36
33
1.58
26937872--26937906
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
26938006--26938047
15
2.7
16
82
14
52
52
2
0
45
1.13
26937759--26938072
154
2.0
156
95
1
569
44
3
5
46
1.41
26938015--26938056
15
2.9
15
82
10
52
52
0
0
47
1.00
26938004--26938300
120
2.5
121
90
6
462
50
5
2
41
1.39
26938125--26938176
15
3.6
15
80
12
56
53
1
0
44
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
26938102--26938192
44
2.1
43
81
6
103
53
3
2
40
1.29
26938044--26938227
59
3.1
59
65
21
148
49
7
2
41
1.42
26938261--26938299
17
2.5
15
80
15
51
51
0
5
43
1.24
26938266--26938299
17
2.0
17
94
0
59
50
0
5
44
1.26
26938332--26938526
93
2.1
92
88
4
286
47
4
4
44
1.41
26941036--26941086
24
2.1
24
100
0
102
33
7
23
35
1.84
26947105--26947226
39
3.1
40
83
5
117
24
27
22
25
2.00
26947129--26947238
39
2.8
39
88
2
159
25
28
20
25
1.99
26958602--26958643
16
2.7
15
85
7
57
45
2
0
52
1.13
26958825--26958858
17
1.9
18
88
5
52
50
5
5
38
1.51
26961770--26961813
22
2.0
22
86
0
61
38
2
4
54
1.33
26964334--26964555
67
3.4
64
74
11
207
31
16
27
23
1.96
26967350--26967519
46
3.6
46
82
8
175
22
28
20
28
1.98
26972332--26972476
40
3.6
40
83
4
175
26
24
25
23
2.00
26980327--26980471
40
3.6
40
85
4
193
25
24
26
23
2.00
26985964--26986039
26
2.9
26
75
14
84
15
28
23
31
1.96
26986065--26986142
25
3.1
25
78
9
77
24
24
20
30
1.98
26987352--26987403
22
2.5
20
75
12
50
63
1
3
30
1.23
26987399--26987442
19
2.4
19
81
14
56
45
2
0
52
1.13
26995826--26995873
20
2.4
21
79
10
55
64
4
0
31
1.12
27000899--27000923
12
2.1
12
100
0
50
32
36
0
32
1.58
27008492--27008528
15
2.3
17
81
13
51
40
0
2
56
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27010756--27010794
18
2.2
17
86
13
53
38
0
0
61
0.96
27019617--27019667
21
2.5
20
81
9
57
31
3
1
62
1.24
27021764--27021837
35
2.1
35
82
5
87
22
27
24
25
2.00
27026266--27026370
26
4.0
26
93
0
183
32
7
23
36
1.83
27027811--27027888
26
2.9
26
78
3
84
35
21
11
30
1.89
27027993--27028187
27
7.2
26
82
6
237
17
23
23
35
1.95
27027993--27028187
54
3.6
54
92
1
320
17
23
23
35
1.95
27035842--27036061
48
4.7
48
72
10
150
22
27
20
30
1.98
27035897--27036064
47
3.6
45
77
8
158
23
26
20
29
1.99
27035891--27036061
94
1.8
94
88
2
263
23
26
20
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352