Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  243  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80477453--80477638
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2
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1.9
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1.98
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239
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27
18
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1.98
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2.6
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11
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142
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0
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13
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37
0
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54
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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28
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295
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28
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2.0
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201
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22
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4.9
49
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26
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27
1.97
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4.4
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27
16
28
27
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1.9
101
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2
313
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17
25
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1.97
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1.99
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11
14
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
1
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1.64
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2.4
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0
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3
30
1.73
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34
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34
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85
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1
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53
43
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5
28
1.75
80714454--80714496
17
2.5
17
84
0
59
32
11
23
32
1.90
80731091--80731164
37
2.0
37
82
15
91
41
24
8
25
1.82
80733345--80733408
27
2.4
28
81
5
78
39
23
7
29
1.83
80733386--80733450
27
2.4
27
75
10
69
26
20
7
46
1.77
80733482--80733605
27
4.6
27
81
6
135
43
21
7
27
1.79
80733440--80733578
54
2.6
52
76
13
131
39
20
10
28
1.86
80733449--80733603
81
1.9
81
82
5
197
42
18
9
29
1.82
80733583--80733668
27
3.1
27
76
17
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39
16
9
34
1.80
80734597--80734666
25
2.8
25
91
0
104
28
25
21
24
1.99
80734597--80734679
25
3.4
25
88
1
96
31
22
21
24
1.98
80734886--80734968
31
2.7
30
90
7
132
30
16
25
27
1.97
80738075--80738100
12
2.2
12
100
0
52
23
7
15
53
1.67
80745015--80745186
93
1.8
93
93
2
301
27
28
21
22
1.99
80745008--80745183
46
3.8
46
78
14
200
28
28
21
21
1.98
80745059--80745202
46
3.1
44
76
15
141
29
28
20
22
1.98
80761656--80761830
27
6.6
27
82
5
203
27
14
28
29
1.95
80769668--80769844
27
6.6
27
83
5
214
27
14
28
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80773448--80773473
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2.2
12
100
0
52
7
0
26
65
1.20
80791603--80791846
40
6.1
40
95
0
375
22
23
28
25
1.99
80793231--80793363
69
1.9
70
89
1
205
32
12
16
38
1.87
80795142--80795381
48
5.0
48
91
2
372
35
6
27
30
1.82
80795142--80795381
98
2.5
96
88
2
372
35
6
27
30
1.82
80795517--80795668
74
2.1
74
94
0
268
26
18
28
25
1.98
80795528--80795672
37
3.9
37
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3
229
25
19
29
25
1.98
80799087--80799153
33
2.0
33
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0
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1.60
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0
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0
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0
1
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1.05
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17
2.3
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12
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0
0
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1.9
20
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2
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28
1.50
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2
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2
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0
97
0
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0
52
1.00
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2.1
22
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20
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100
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1.84
80855150--80855280
26
5.2
26
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2
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20
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1.98
80855150--80855280
52
2.6
51
90
4
205
29
20
22
27
1.98
80855418--80855509
42
2.2
42
90
0
139
30
14
20
34
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80855533--80855647
31
3.7
31
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1
196
29
15
26
28
1.96
80858369--80858406
14
2.7
15
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62
0
26
0
73
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1.9
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36
10
0
53
1.35
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47
2.6
47
93
2
203
25
20
26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80883682--80883706
11
2.3
11
100
0
50
28
0
0
72
0.86
80909319--80909368
28
1.9
26
84
15
68
24
24
12
40
1.88
80911419--80911473
20
2.7
19
83
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21
34
0
43
1.53
80911989--80912162
87
2.0
87
93
0
294
27
22
10
40
1.86
80914721--80914771
19
2.7
18
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24
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41
0
1
56
1.10
80914731--80914769
20
2.0
20
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41
0
2
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80915074--80915121
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2.5
20
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6
0
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48
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26
19
25
28
1.99
80916467--80916679
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2.3
92
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243
26
19
25
28
1.99
80924258--80924390
48
2.8
48
84
0
176
27
17
24
30
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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