Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  32  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10314063--10314106
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1
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7
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1
1
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1.9
28
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1
1
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1
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1.22
10336508--10336672
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1
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1
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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45
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36
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27
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1.99
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2.0
23
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2.2
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0
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18
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53
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3
129
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1
19
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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185
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1.33
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2.1
34
84
7
90
39
2
2
54
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10542580--10542624
20
2.1
21
84
15
58
62
2
0
35
1.08
10542575--10542624
22
2.3
22
85
0
64
64
2
0
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1.05
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83
59
2
0
38
1.12
10565822--10565936
53
2.2
53
91
0
185
30
17
24
27
1.97
10565822--10565967
53
2.7
52
87
4
184
28
15
26
29
1.96
10572168--10572320
47
3.2
46
85
2
171
32
28
16
23
1.96
10574454--10574483
15
2.0
15
93
0
51
40
10
20
30
1.85
10575086--10575562
235
2.0
235
93
0
819
35
8
21
34
1.84
10580150--10580282
18
7.5
17
88
5
185
36
12
11
39
1.79
10580150--10580291
35
4.0
35
95
2
239
37
13
10
38
1.79
10583030--10583060
12
2.6
12
94
0
53
0
25
0
74
0.82
10583293--10583326
8
4.2
8
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0
59
47
0
0
52
1.00
10583447--10583477
15
2.1
14
94
5
53
54
6
3
35
1.42
10583464--10583532
21
3.4
20
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16
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55
7
1
36
1.37
10587649--10587673
13
1.9
13
100
0
50
72
0
16
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1.13
10587706--10587746
19
2.2
19
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8
57
78
0
21
0
0.76
10588346--10588372
3
9.0
3
100
0
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0
0
66
0.92
10588429--10588906
236
2.0
235
93
0
821
34
8
23
32
1.86
10589011--10589043
6
5.5
6
92
0
57
18
21
15
45
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10589011--10589049
18
2.2
18
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0
51
17
25
12
43
1.85
10597427--10597455
10
3.0
10
95
5
51
79
0
20
0
0.74
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16
2.5
17
81
14
50
36
4
2
56
1.34
10601302--10601353
11
4.9
11
79
9
63
28
26
0
44
1.55
10601292--10601353
20
2.9
21
86
13
83
29
25
0
45
1.54
10601380--10601410
15
2.1
15
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0
53
22
6
0
70
1.09
10603132--10603174
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2.4
18
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0
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16
27
11
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1.82
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116
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3
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48
1.50
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4.3
126
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0
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26
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33
1.96
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1.8
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4
241
40
14
2
43
1.58
10625981--10626029
26
1.9
25
87
4
71
44
0
12
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1.41
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43
2.0
43
82
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106
47
3
2
46
1.31
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16
2.5
17
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11
59
60
0
0
39
0.96
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3.6
35
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0
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24
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1.90
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8
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4
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40
33
0
26
1.57
10657278--10657369
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2.1
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2
177
36
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18
31
1.89
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3.7
46
75
13
174
20
21
28
29
1.98
10659696--10659866
93
1.8
93
92
0
288
20
21
29
28
1.98
10663047--10663155
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1.9
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100
0
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36
14
22
25
1.93
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35
1.9
35
100
0
136
44
2
8
44
1.50
10671861--10671888
14
2.0
14
100
0
56
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21
7
35
1.81
10673434--10673478
23
2.0
23
82
8
56
51
0
0
48
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10679386--10679505
53
2.3
53
92
0
195
29
23
18
29
1.98
10682448--10682480
10
3.3
10
91
8
50
30
0
3
66
1.06
10682445--10682480
17
2.1
17
94
0
63
30
0
2
66
1.06
10683512--10683560
18
2.7
18
93
0
80
36
0
8
55
1.30
10683514--10683561
3
16.0
3
82
0
60
35
0
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58
1.23
10683514--10683561
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4.0
12
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0
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35
0
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58
1.23
10683917--10684012
39
2.5
39
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108
20
23
28
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1.99
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3.0
9
100
0
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0
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13
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59
0
0
40
0.97
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46
3.8
46
77
10
178
30
29
19
20
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352