Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  31  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10022988--10023012
11
2.3
11
100
0
50
92
0
8
0
0.40
10027222--10027274
24
2.2
24
96
0
97
24
15
0
60
1.35
10028413--10028464
15
3.2
15
73
19
50
46
0
0
53
1.00
10028426--10028462
19
1.9
19
88
0
56
51
0
0
48
1.00
10028497--10028533
16
2.3
16
86
13
58
40
0
0
59
0.97
10028435--10028604
73
2.3
74
79
10
177
47
0
2
50
1.14
10028558--10028601
22
2.0
22
90
0
70
45
0
0
54
0.99
10032863--10032920
30
1.9
30
89
0
89
41
3
24
31
1.71
10033132--10033163
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
10033258--10033499
50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
10033258--10033507
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
10037683--10037735
19
2.9
18
74
17
56
54
5
5
33
1.47
10039126--10039168
18
2.3
19
84
15
54
62
0
6
30
1.21
10042102--10042183
25
3.2
25
65
20
62
34
18
7
40
1.78
10044782--10044820
21
1.9
20
84
5
51
48
0
10
41
1.37
10044970--10045015
19
2.4
19
85
3
56
58
2
0
39
1.10
10044979--10045029
19
2.7
18
81
6
57
49
1
0
49
1.12
10060653--10060692
19
2.1
19
85
0
53
42
35
7
15
1.75
10062275--10062304
6
4.8
6
92
8
51
50
13
0
36
1.42
10062276--10062301
13
2.0
13
100
0
52
46
15
0
38
1.46
10063269--10063638
132
2.8
130
85
3
483
30
18
17
33
1.94
10066378--10066407
11
2.8
11
95
5
53
40
23
16
20
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10078881--10078905
11
2.3
11
100
0
50
24
8
0
68
1.16
10079005--10079038
17
2.0
17
88
0
50
41
8
5
44
1.60
10079770--10079805
15
2.4
15
90
0
54
41
8
2
47
1.48
10082444--10082498
21
2.6
21
86
11
69
27
0
0
72
0.85
10082464--10082499
10
3.5
10
85
7
54
27
0
0
72
0.85
10087488--10087535
9
4.9
9
78
16
51
64
0
2
33
1.05
10087474--10087535
30
2.0
32
87
12
94
66
0
1
32
1.02
10092806--10092831
13
2.0
13
100
0
52
38
0
38
23
1.55
10095167--10095209
20
2.1
20
86
4
59
23
6
4
65
1.37
10097406--10097467
28
2.2
29
83
8
76
35
3
3
58
1.31
10098517--10098846
128
2.6
128
82
2
403
27
16
17
37
1.92
10099637--10099695
28
2.1
28
81
12
68
49
8
6
35
1.60
10103526--10103578
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
10104932--10105010
35
2.2
36
95
4
142
15
5
8
70
1.29
10106032--10106257
124
1.8
125
90
3
368
42
7
7
42
1.61
10106662--10106712
26
2.0
26
84
0
66
50
5
3
39
1.45
10107117--10107271
77
2.0
77
91
0
247
25
20
9
44
1.81
10123734--10123769
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
10123721--10123761
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
10123884--10124018
39
3.4
38
73
8
101
28
28
20
23
1.99
10124258--10124296
18
2.1
19
90
4
62
48
10
0
41
1.37
10125618--10125670
5
10.0
5
80
11
61
56
1
0
41
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10125617--10125672
12
4.5
12
81
16
69
55
1
0
42
1.10
10125975--10126027
27
2.0
27
96
0
97
24
20
26
28
1.99
10129497--10129577
33
2.5
33
87
0
108
25
13
44
16
1.84
10132142--10132274
60
2.2
62
86
4
182
57
12
0
30
1.35
10132391--10132438
19
2.5
19
80
10
53
0
35
0
64
0.94
10132559--10132667
32
3.5
31
75
7
121
23
18
41
16
1.90
10138108--10138255
48
3.1
48
89
0
224
29
24
7
38
1.83
10139525--10139577
27
2.0
27
85
3
72
39
20
11
28
1.87
10139878--10139920
21
2.0
23
81
9
54
44
23
9
23
1.82
10141122--10141295
46
3.7
46
76
15
137
25
29
17
27
1.97
10141126--10141295
94
1.8
93
86
5
245
25
29
16
28
1.97
10144499--10144885
43
9.0
43
88
2
517
30
28
16
25
1.96
10144655--10144723
22
3.2
22
61
19
54
31
26
15
26
1.96
10144499--10144885
129
3.0
129
89
0
587
30
28
16
25
1.96
10146526--10146635
15
7.3
15
70
11
91
25
23
25
25
2.00
10146516--10146643
30
4.3
30
95
0
238
27
25
25
21
2.00
10148861--10148961
23
4.2
25
82
6
86
23
22
18
34
1.96
10148876--10148961
23
3.7
23
86
7
120
22
23
18
36
1.95
10152543--10152576
17
2.0
17
88
0
50
70
2
2
23
1.15
10152956--10153021
27
2.4
27
89
0
96
10
46
21
21
1.80
10156999--10157042
21
2.1
21
100
0
88
50
0
0
50
1.00
10162888--10162934
24
2.0
24
86
0
67
31
6
21
40
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10167090--10167151
19
3.3
19
71
24
67
59
6
6
27
1.47
10167078--10167155
38
2.1
38
100
0
156
61
5
7
25
1.44
10174658--10174698
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
10185747--10185967
74
3.1
73
70
10
193
32
19
21
26
1.97
10189082--10189143
29
2.1
30
88
8
92
25
3
11
59
1.46
10190521--10190773
138
1.8
138
87
1
382
20
24
13
41
1.88
10190751--10190794
21
2.1
21
95
0
79
22
29
15
31
1.95
10190705--10190840
67
2.0
67
97
0
254
23
25
13
37
1.92
10190516--10190773
46
5.6
46
87
0
347
20
24
13
41
1.89
10192088--10192143
11
4.9
11
82
8
67
62
3
0
33
1.12
10195070--10195236
46
3.6
46
85
3
219
19
23
14
41
1.89
10196969--10197027
24
2.6
22
83
5
82
62
1
0
35
1.05
10196969--10197024
11
4.9
11
85
8
76
62
1
0
35
1.06
10205767--10205817
24
2.1
25
85
3
68
37
7
15
39
1.77
10211600--10211751
43
3.5
42
79
10
157
32
24
17
25
1.97
10211581--10211738
42
3.7
42
79
8
160
30
25
18
24
1.98
10215571--10215622
17
3.0
17
75
10
52
55
11
3
28
1.53
10217515--10217565
20
2.5
20
75
9
59
50
0
5
43
1.26
10224431--10224486
20
2.8
20
86
2
76
12
16
8
62
1.53
10229401--10229427
6
4.5
6
100
0
54
33
18
18
29
1.95
10231753--10231789
18
2.1
18
94
0
65
10
24
16
48
1.77
10237649--10237696
20
2.5
20
86
10
64
66
2
6
25
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10237691--10237752
27
2.3
26
78
8
70
51
11
0
37
1.38
10252137--10252171
13
2.6
13
95
4
61
17
0
8
74
1.06
10252126--10252171
14
3.2
15
82
14
53
21
0
8
69
1.15
10252323--10252397
37
2.0
37
100
0
150
29
5
37
28
1.79
10252636--10252683
23
2.1
23
100
0
96
20
0
31
47
1.50
10254419--10254486
28
2.4
28
73
4
66
32
7
2
57
1.41
10255761--10255812
26
2.0
26
84
0
68
57
3
9
28
1.48
10256056--10256158
44
2.2
44
80
14
111
58
2
4
33
1.34
10256056--10256172
25
5.0
24
69
20
86
57
2
4
35
1.32
10256128--10256194
11
6.4
11
75
13
61
59
1
1
37
1.16
10256143--10256180
13
2.9
13
92
0
58
55
0
2
42
1.14
10257927--10258012
45
1.9
45
95
0
154
26
30
13
29
1.95
10258106--10258616
205
2.5
204
87
1
693
29
21
18
30
1.97
10269036--10269087
26
2.0
26
84
0
68
57
3
9
28
1.48
10269356--10269452
20
4.5
20
75
18
79
60
2
2
35
1.20
10269370--10269454
11
7.5
11
73
12
64
61
1
2
35
1.17
10269317--10269461
45
3.2
44
78
13
136
57
3
4
35
1.35
10269317--10269461
22
6.5
21
74
18
107
57
3
4
35
1.35
10276297--10276363
29
2.3
29
84
7
82
5
64
2
26
1.31
10276502--10276547
6
7.8
6
92
4
76
28
0
71
0
0.86
10280810--10280876
28
2.3
28
82
14
75
38
2
1
56
1.24
10285525--10285609
43
2.0
43
95
0
152
22
15
11
50
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10303293--10303335
20
2.2
20
86
0
59
65
2
4
27
1.25
10310891--10311048
3
53.3
3
76
5
88
59
0
8
31
1.31
10311147--10311203
23
2.5
23
72
11
62
64
0
7
28
1.19
10311277--10311787
3
169.3
3
67
12
145
60
2
7
28
1.38
10311274--10311311
17
2.2
17
90
0
58
63
2
2
31
1.22
10311445--10311518
23
3.3
22
78
14
80
64
1
6
27
1.26
10311438--10311557
58
2.1
58
83
9
147
60
1
8
29
1.35
10311727--10311812
41
2.1
41
85
8
113
59
3
1
36
1.22
10311798--10311840
14
2.7
16
79
20
54
51
0
2
46
1.13
10311804--10311841
14
2.7
14
95
0
67
52
0
2
44
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352