Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  290  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95407083--95407142
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2.8
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1.99
95425033--95425090
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2.8
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1.9
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19
19
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95462947--95463135
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3.5
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42
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.7
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2.0
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67
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2.0
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31
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26
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2.0
20
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0
12
12
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.00
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0
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17
27
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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13
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30
30
1.94
95589171--95589224
25
2.2
25
93
0
90
18
16
24
40
1.90
95589939--95590228
144
2.0
144
100
0
580
27
18
15
38
1.91
95593768--95593977
44
4.8
44
84
0
258
27
24
15
32
1.95
95593945--95594005
31
2.0
30
87
6
88
34
21
16
27
1.95
95593901--95594050
75
2.0
75
93
0
255
28
24
16
30
1.96
95593976--95594248
44
6.2
44
91
0
429
27
25
16
30
1.96
95593782--95594182
207
1.9
207
89
1
624
27
25
15
32
1.95
95594462--95594513
27
1.9
27
100
0
104
25
15
21
38
1.92
95606337--95606382
17
2.8
17
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18
62
60
2
4
32
1.28
95606403--95606453
17
3.1
17
82
2
68
58
0
7
33
1.27
95606711--95606768
30
1.9
30
82
0
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55
6
13
24
1.63
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38
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38
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3
117
51
8
4
36
1.51
95610863--95610921
30
2.0
30
86
6
84
33
6
18
40
1.77
95611907--95611932
2
13.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
95616361--95616386
13
2.0
13
100
0
52
46
15
7
30
1.74
95620187--95620243
27
2.1
27
96
0
105
31
15
8
43
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95621493--95621533
22
1.9
21
85
14
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63
2
9
24
1.37
95621545--95621578
18
1.9
18
94
5
61
61
5
5
26
1.42
95622273--95622333
10
6.1
10
81
11
63
68
3
6
21
1.27
95622319--95622369
23
2.1
26
82
10
63
56
9
1
31
1.43
95623902--95623954
20
2.7
20
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8
72
30
7
16
45
1.75
95631779--95631840
30
2.1
30
96
0
115
30
25
6
37
1.81
95633735--95633791
29
2.0
29
85
0
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33
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10
29
1.90
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13
1.92
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2.4
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3
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25
20
14
1.91
95638589--95638661
21
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21
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3
119
34
28
24
12
1.92
95639044--95639101
15
3.8
15
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2
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0
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2.2
17
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0
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7
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77
49
14
16
19
1.80
95651238--95651284
22
2.2
22
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3
60
65
0
25
8
1.20
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18
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38
2
0
59
1.10
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2.0
17
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0
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1.37
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7.8
6
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0
85
17
19
0
63
1.30
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3
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3
100
0
76
34
0
0
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0.93
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22
2.0
22
95
0
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44
4
0
51
1.21
95680787--95680921
56
2.4
56
84
0
189
26
13
23
36
1.92
95685514--95685562
24
2.0
24
100
0
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20
24
22
1.98
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43
2.9
42
81
7
154
32
27
18
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95692632--95692772
56
2.5
56
82
8
162
27
13
29
29
1.94
95692824--95692891
32
2.1
32
94
0
118
33
5
29
30
1.81
95698830--95698902
36
2.0
36
86
0
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16
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1.90
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14
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50
75
3
0
21
0.93
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22
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25
24
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1.99
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2.0
41
100
0
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24
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48
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138
40
27
12
19
1.88
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24
2.2
24
89
0
79
54
5
1
37
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352